More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02470 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  100 
 
 
706 aa  1456    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  37.41 
 
 
643 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  35.68 
 
 
385 aa  222  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  34.13 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.84 
 
 
606 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 
607 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 
462 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  31.02 
 
 
773 aa  151  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.74 
 
 
815 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  28.27 
 
 
536 aa  144  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.65 
 
 
560 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.97 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.63 
 
 
812 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.65 
 
 
560 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.65 
 
 
560 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.74 
 
 
560 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  27.39 
 
 
967 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 
560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.7 
 
 
1077 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 
813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 
1287 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  26.22 
 
 
938 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.37 
 
 
459 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 
524 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 
967 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  30.56 
 
 
987 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.8 
 
 
550 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  27.76 
 
 
949 aa  125  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.14 
 
 
979 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.4 
 
 
545 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 
545 aa  124  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  28.61 
 
 
469 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  28.02 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 
538 aa  121  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  27.62 
 
 
475 aa  120  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 
586 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  27.54 
 
 
1418 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  27.86 
 
 
905 aa  118  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.34 
 
 
629 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 
586 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  26.56 
 
 
1033 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  27.45 
 
 
1062 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  26.56 
 
 
1033 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 
510 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.3 
 
 
949 aa  111  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 
586 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  26.26 
 
 
586 aa  111  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.01 
 
 
974 aa  110  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  25.94 
 
 
848 aa  110  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  26.12 
 
 
1029 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.46 
 
 
586 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  26.46 
 
 
586 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  26.52 
 
 
586 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 
586 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  27.46 
 
 
585 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  26.46 
 
 
586 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  26.52 
 
 
586 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  26.84 
 
 
1348 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 
585 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 
591 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.46 
 
 
586 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 
586 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  27.46 
 
 
585 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 
602 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 
512 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.18 
 
 
504 aa  107  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  25.54 
 
 
956 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  26.62 
 
 
613 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3708  helicase-like  31.38 
 
 
295 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  30 
 
 
1035 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  26.52 
 
 
579 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  26.4 
 
 
586 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  26.4 
 
 
586 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  26.4 
 
 
586 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  26.33 
 
 
585 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 
1051 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  27.14 
 
 
946 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  26.83 
 
 
586 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  26.4 
 
 
586 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  26.4 
 
 
586 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  23.76 
 
 
829 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  24.38 
 
 
1063 aa  104  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 
584 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  24.12 
 
 
1033 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.32 
 
 
584 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 
584 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  26.58 
 
 
1149 aa  103  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 
979 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  26.74 
 
 
1028 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  25.18 
 
 
928 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 
584 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 
1053 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  23.76 
 
 
821 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.35 
 
 
590 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  22.98 
 
 
590 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  22.88 
 
 
761 aa  100  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  24.29 
 
 
982 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  23.27 
 
 
825 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>