More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2523 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  55.76 
 
 		 987 aa  1044    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.58 
 
 		 979 aa  1070    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  47.02 
 
 		 1287 aa  848    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 967 aa  2011    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  39.04 
 
 		 1077 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  40.11 
 
 		 938 aa  512  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  37.65 
 
 		 956 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  40.88 
 
 		 928 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  35.02 
 
 		 1418 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  34.56 
 
 		 848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  33.91 
 
 		 1348 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 		 813 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  32.46 
 
 		 812 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 815 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  37.92 
 
 		 993 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  34.49 
 
 		 1053 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  32.36 
 
 		 979 aa  336  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  33.75 
 
 		 946 aa  323  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.83 
 
 		 974 aa  320  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  34.88 
 
 		 1149 aa  314  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  37.83 
 
 		 967 aa  308  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  33.03 
 
 		 1062 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  33.18 
 
 		 1033 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  32.58 
 
 		 1033 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  32.2 
 
 		 1033 aa  299  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  35.12 
 
 		 1051 aa  297  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  35.23 
 
 		 1063 aa  291  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  32.73 
 
 		 1043 aa  290  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  33.56 
 
 		 1017 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 1035 aa  289  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  33.12 
 
 		 1066 aa  288  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  32.09 
 
 		 1029 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 1028 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  32.29 
 
 		 952 aa  283  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  30.77 
 
 		 949 aa  279  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  33.04 
 
 		 1058 aa  278  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 980 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  32.58 
 
 		 1052 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  30.09 
 
 		 953 aa  274  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  30.09 
 
 		 953 aa  274  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  31.85 
 
 		 1061 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  31.74 
 
 		 1041 aa  270  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  32.49 
 
 		 982 aa  268  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 1055 aa  268  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.4 
 
 		 1031 aa  267  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  33.88 
 
 		 1065 aa  267  8.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  31.71 
 
 		 1051 aa  266  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  31.93 
 
 		 1055 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  31.66 
 
 		 1055 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  31.53 
 
 		 949 aa  263  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 		 1042 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 1042 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  29.54 
 
 		 905 aa  233  1e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  34.63 
 
 		 773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  31.13 
 
 		 385 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.19 
 
 		 643 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  30.75 
 
 		 536 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 475 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.55 
 
 		 462 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.75 
 
 		 606 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.22 
 
 		 607 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  27.39 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  30.15 
 
 		 524 aa  139  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  30.72 
 
 		 581 aa  134  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 459 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.8 
 
 		 469 aa  130  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  27.83 
 
 		 796 aa  128  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.42 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  27.05 
 
 		 791 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  25.46 
 
 		 860 aa  125  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.66 
 
 		 398 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.73 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.35 
 
 		 560 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.66 
 
 		 560 aa  121  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 		 560 aa  121  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.35 
 
 		 560 aa  121  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  29 
 
 		 629 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.74 
 
 		 560 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 545 aa  118  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  27.45 
 
 		 545 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2220  hypothetical protein  63.95 
 
 		 294 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.562631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.74 
 
 		 556 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  27.63 
 
 		 796 aa  114  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  27.92 
 
 		 790 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  27.6 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25.37 
 
 		 1115 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  27.6 
 
 		 760 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  27.63 
 
 		 793 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  26.54 
 
 		 586 aa  111  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  28.87 
 
 		 793 aa  112  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  26.59 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  28.87 
 
 		 788 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  25.85 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 550 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  26.99 
 
 		 797 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  26.11 
 
 		 811 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  28.42 
 
 		 790 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 586 aa  108  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 776 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 		 558 aa  107  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>