More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02656 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  57.46 
 
 
586 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  57.46 
 
 
586 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  58.42 
 
 
586 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  57.44 
 
 
585 aa  699    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  56.8 
 
 
591 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  57.46 
 
 
586 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  57.63 
 
 
586 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  57.46 
 
 
586 aa  708    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  57.8 
 
 
586 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  78.28 
 
 
574 aa  940    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  57.46 
 
 
586 aa  709    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  55.26 
 
 
613 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  57.63 
 
 
586 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  56.23 
 
 
586 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  56.87 
 
 
586 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1216    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  57.44 
 
 
585 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  57.04 
 
 
585 aa  700    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  57.46 
 
 
586 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  57.8 
 
 
586 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  95.88 
 
 
583 aa  1179    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  56.7 
 
 
586 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  57.63 
 
 
586 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  67.3 
 
 
584 aa  833    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  57.46 
 
 
586 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  54.72 
 
 
585 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  57.44 
 
 
585 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  57.46 
 
 
586 aa  710    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  82.65 
 
 
657 aa  1029    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  51.72 
 
 
579 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  48.64 
 
 
597 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  51.11 
 
 
590 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  50.6 
 
 
590 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  50.6 
 
 
590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  48.97 
 
 
586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  49.83 
 
 
583 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  50.09 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  49.83 
 
 
584 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  50 
 
 
584 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  49.83 
 
 
584 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  49.83 
 
 
584 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  49.57 
 
 
602 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  50 
 
 
590 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  48.13 
 
 
616 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  49.57 
 
 
580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  48.88 
 
 
580 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  47.59 
 
 
580 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  34.33 
 
 
678 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  37.16 
 
 
545 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  37.19 
 
 
538 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  37.16 
 
 
545 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  36.41 
 
 
545 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  34.32 
 
 
550 aa  220  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  34.95 
 
 
569 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.77 
 
 
475 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 
581 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 
536 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 
462 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.66 
 
 
469 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  30.19 
 
 
629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.38 
 
 
560 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 
606 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.33 
 
 
504 aa  130  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  30.09 
 
 
848 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.89 
 
 
560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.56 
 
 
560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.08 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 
560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 
560 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.4 
 
 
560 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.79 
 
 
398 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.29 
 
 
607 aa  124  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 
967 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 
938 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  30.25 
 
 
1077 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.9 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.68 
 
 
813 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.29 
 
 
812 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  29.38 
 
 
1043 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  30.63 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 
1055 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  27.14 
 
 
1017 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 
993 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 
524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 
1348 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 
1055 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.82 
 
 
905 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  28.24 
 
 
539 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  28.98 
 
 
1055 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.49 
 
 
1053 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 
1066 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.91 
 
 
773 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 
1052 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.94 
 
 
815 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  30 
 
 
1058 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 
967 aa  107  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25.5 
 
 
643 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  28.69 
 
 
982 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 
1061 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 
1028 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>