More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2567 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  37.74 
 
 		 980 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  66.49 
 
 		 952 aa  1310    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 953 aa  1936    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  40.13 
 
 		 949 aa  677    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 953 aa  1936    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.07 
 
 		 974 aa  687    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  40.31 
 
 		 946 aa  667    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  41.78 
 
 		 949 aa  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  40.62 
 
 		 1149 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 1053 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  32.13 
 
 		 993 aa  432  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 938 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  28.87 
 
 		 1062 aa  317  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  36.59 
 
 		 848 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  32.68 
 
 		 1077 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  33.61 
 
 		 979 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.53 
 
 		 813 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  28.93 
 
 		 1418 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  26.54 
 
 		 1051 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.74 
 
 		 979 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.09 
 
 		 1287 aa  300  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  26.23 
 
 		 1042 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  26.51 
 
 		 1041 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  30.98 
 
 		 815 aa  299  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 		 1066 aa  297  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  30.42 
 
 		 987 aa  296  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  30.61 
 
 		 812 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 		 1063 aa  295  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  27.36 
 
 		 1035 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  31.52 
 
 		 1028 aa  287  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 		 1033 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  32.42 
 
 		 1042 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  27.69 
 
 		 1348 aa  284  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  34.25 
 
 		 1043 aa  281  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  33.66 
 
 		 1017 aa  281  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  31.18 
 
 		 1033 aa  280  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  32.57 
 
 		 1061 aa  279  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  31.35 
 
 		 956 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 1033 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  34.9 
 
 		 1052 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  31.35 
 
 		 928 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 1055 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.62 
 
 		 1055 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.52 
 
 		 1055 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  30.09 
 
 		 967 aa  274  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 1058 aa  271  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  32.41 
 
 		 1051 aa  270  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  33.11 
 
 		 982 aa  270  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.61 
 
 		 905 aa  268  5e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  26.46 
 
 		 1065 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.8 
 
 		 1031 aa  262  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 1029 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.04 
 
 		 967 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  34.66 
 
 		 773 aa  190  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 524 aa  127  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  24.3 
 
 		 606 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 		 629 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 607 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1131 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25.86 
 
 		 1115 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  26.5 
 
 		 1126 aa  111  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  25.18 
 
 		 545 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  26.48 
 
 		 469 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  24.12 
 
 		 459 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  24.58 
 
 		 545 aa  109  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.66 
 
 		 560 aa  108  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.22 
 
 		 385 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  25.21 
 
 		 560 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 1133 aa  105  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 590 aa  104  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.63 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  24.73 
 
 		 550 aa  104  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 479 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  26.17 
 
 		 1108 aa  102  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 590 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  24.5 
 
 		 1125 aa  102  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  25.75 
 
 		 583 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 		 560 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  25.63 
 
 		 398 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 479 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 590 aa  101  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 479 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  24.93 
 
 		 545 aa  101  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 538 aa  101  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  25.9 
 
 		 583 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.63 
 
 		 560 aa  100  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.18 
 
 		 581 aa  99.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 586 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 1138 aa  99.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  25.78 
 
 		 1141 aa  99  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 479 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 584 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 586 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.32 
 
 		 657 aa  97.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  22.81 
 
 		 586 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>