More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2082 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  56.54 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  56.54 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  56.89 
 
 		 586 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  56.89 
 
 		 586 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  56.89 
 
 		 586 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  55.94 
 
 		 586 aa  685    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  56.54 
 
 		 586 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  57.52 
 
 		 585 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  56.54 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  57.77 
 
 		 586 aa  700    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  57.07 
 
 		 586 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  100 
 
 		 574 aa  1191    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  54.3 
 
 		 613 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  56.82 
 
 		 585 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  77.93 
 
 		 583 aa  965    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  57.07 
 
 		 586 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  56.82 
 
 		 585 aa  685    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  56.82 
 
 		 586 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  78.28 
 
 		 583 aa  962    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  56.72 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  56.54 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  56.12 
 
 		 586 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  56.54 
 
 		 586 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  55.46 
 
 		 591 aa  674    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  67.02 
 
 		 584 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  56.82 
 
 		 585 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  56.37 
 
 		 586 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  77.22 
 
 		 657 aa  954    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  52.41 
 
 		 585 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  49.04 
 
 		 579 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  48.05 
 
 		 597 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  50.43 
 
 		 602 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  47.92 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  49.74 
 
 		 580 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  50.35 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  50.17 
 
 		 584 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  50.17 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  50.35 
 
 		 584 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  52.46 
 
 		 590 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  49.74 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  52.27 
 
 		 590 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  47.99 
 
 		 583 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  49.91 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  52.18 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  48.17 
 
 		 580 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  46.89 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  46.77 
 
 		 580 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  33.07 
 
 		 678 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  36.14 
 
 		 545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  36.32 
 
 		 538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  36.16 
 
 		 545 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  35.91 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  34.81 
 
 		 550 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  34.79 
 
 		 569 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  33.69 
 
 		 629 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  28.48 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.06 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  31.23 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.2 
 
 		 504 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.92 
 
 		 462 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.08 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.91 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.93 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.99 
 
 		 560 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  27.93 
 
 		 560 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  27.68 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  27.22 
 
 		 398 aa  120  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 		 813 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 1077 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 812 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 		 938 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 524 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 		 848 aa  116  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  28.84 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 1053 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.82 
 
 		 773 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25.74 
 
 		 797 aa  114  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  28.2 
 
 		 1017 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 815 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 967 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 1066 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  29.6 
 
 		 1063 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  29.13 
 
 		 1052 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 1287 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 		 1043 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  27.51 
 
 		 503 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 1051 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  29.68 
 
 		 1028 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.5 
 
 		 804 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.68 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 993 aa  109  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  26.59 
 
 		 790 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.75 
 
 		 761 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 1055 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>