More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3418 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  64.97 
 
 		 545 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  65.52 
 
 		 545 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1070    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  64.61 
 
 		 545 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  69.84 
 
 		 569 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  45.94 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  36.27 
 
 		 586 aa  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  36.27 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  36.27 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  35.78 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  36.03 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  36.03 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  36.03 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  36.03 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  36.03 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  35.54 
 
 		 586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  35.54 
 
 		 586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 585 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  35.29 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  34.57 
 
 		 583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  35.29 
 
 		 586 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.31 
 
 		 657 aa  220  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  34.32 
 
 		 583 aa  220  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  37.35 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.81 
 
 		 574 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  35.28 
 
 		 585 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  36.39 
 
 		 585 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  35.15 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  36.39 
 
 		 585 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  36.39 
 
 		 585 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  33.42 
 
 		 586 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  31.22 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  34.9 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  31.45 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  35.15 
 
 		 586 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  32.83 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  31.45 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  30.52 
 
 		 590 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  30.22 
 
 		 590 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 590 aa  204  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  32.43 
 
 		 584 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  33.82 
 
 		 591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  32.98 
 
 		 597 aa  200  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  30.15 
 
 		 580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  29.49 
 
 		 616 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  31.05 
 
 		 602 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 		 584 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  31.36 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 		 584 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  31.57 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  34.06 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  32.57 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.69 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.52 
 
 		 462 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  29.93 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  34.52 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 678 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.5 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  32.35 
 
 		 1066 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.9 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.9 
 
 		 560 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.65 
 
 		 606 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.89 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 		 560 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  30.05 
 
 		 643 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 967 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  29.41 
 
 		 773 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.41 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 560 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  27.64 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  30.94 
 
 		 1062 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 848 aa  127  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  29.92 
 
 		 706 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.3 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  30.12 
 
 		 1418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 		 1052 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 1051 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  29.62 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  24.56 
 
 		 993 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 		 1287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 938 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  29.81 
 
 		 1029 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  31.14 
 
 		 1348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.59 
 
 		 1031 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 		 1033 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  28.08 
 
 		 1028 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  30.63 
 
 		 1033 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  30.89 
 
 		 1033 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  28.41 
 
 		 1063 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.59 
 
 		 967 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  25.13 
 
 		 905 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  28.85 
 
 		 1065 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>