More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1537 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  46.87 
 
 
771 aa  670    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  74.97 
 
 
811 aa  1233    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  68 
 
 
760 aa  1097    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  62.16 
 
 
797 aa  1021    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
776 aa  1595    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  75.94 
 
 
802 aa  1258    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  68.26 
 
 
760 aa  1099    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  75.93 
 
 
783 aa  1239    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  52.15 
 
 
860 aa  837    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  65.67 
 
 
804 aa  1053    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  40.43 
 
 
770 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  39.03 
 
 
790 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  39.92 
 
 
796 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  38.26 
 
 
791 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  35.81 
 
 
770 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  35.33 
 
 
788 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  35.01 
 
 
824 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  34.43 
 
 
790 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  33.66 
 
 
796 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  34.02 
 
 
793 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  34.15 
 
 
787 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  34.45 
 
 
825 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  34.89 
 
 
800 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  33.66 
 
 
811 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  34.92 
 
 
827 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  34.07 
 
 
791 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  35.05 
 
 
817 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  34.58 
 
 
813 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  34.54 
 
 
761 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  34.25 
 
 
815 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  34.54 
 
 
824 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  35.03 
 
 
776 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  34.25 
 
 
815 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  34.87 
 
 
810 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  32.97 
 
 
829 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  34.14 
 
 
793 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  33.13 
 
 
821 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  34.74 
 
 
780 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  35.35 
 
 
784 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  35.35 
 
 
784 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  34.17 
 
 
765 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  34.66 
 
 
783 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  33.37 
 
 
809 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  37.76 
 
 
875 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  38.64 
 
 
780 aa  355  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  36.59 
 
 
899 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  36.94 
 
 
899 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  38.05 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  32.29 
 
 
769 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 
787 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  29.57 
 
 
936 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  31.67 
 
 
932 aa  193  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 
932 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  29.39 
 
 
933 aa  188  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 
936 aa  187  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2790  DEAD/DEAH box helicase-like protein  65.52 
 
 
140 aa  183  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 
1005 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.43 
 
 
1124 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.35 
 
 
1082 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  29.19 
 
 
1137 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  29.22 
 
 
1137 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.14 
 
 
1137 aa  161  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  29.48 
 
 
1119 aa  160  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 
1137 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.93 
 
 
1169 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.14 
 
 
1126 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  28.74 
 
 
1113 aa  159  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  28.9 
 
 
1137 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.71 
 
 
1169 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 
1130 aa  159  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  27.95 
 
 
893 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  29.06 
 
 
1108 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 
1137 aa  157  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.55 
 
 
1080 aa  157  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  29.78 
 
 
1170 aa  157  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 
907 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.9 
 
 
1188 aa  154  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.69 
 
 
1174 aa  153  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  26.82 
 
 
945 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.51 
 
 
1167 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 
753 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 
889 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  28.71 
 
 
1125 aa  150  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 
1233 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  29.15 
 
 
1115 aa  149  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  26.97 
 
 
912 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 
1126 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  35.79 
 
 
546 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 
1129 aa  146  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  28.64 
 
 
1133 aa  146  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  27.89 
 
 
1115 aa  144  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  27.49 
 
 
934 aa  143  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  29.45 
 
 
1131 aa  141  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  25.26 
 
 
925 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 
1138 aa  140  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  26.15 
 
 
921 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.39 
 
 
1157 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  27.31 
 
 
846 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  28.25 
 
 
1141 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  27.74 
 
 
1138 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>