More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0725 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1005 aa  2085    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  42.88 
 
 		 945 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  42.81 
 
 		 936 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  42.9 
 
 		 932 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  42.52 
 
 		 932 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  43.89 
 
 		 933 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  43 
 
 		 936 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  41.98 
 
 		 907 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  41.68 
 
 		 1131 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  42.39 
 
 		 1137 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  40.11 
 
 		 912 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  42.25 
 
 		 1125 aa  371  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  39.04 
 
 		 1115 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  39.9 
 
 		 1138 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  41.85 
 
 		 1137 aa  366  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  41.95 
 
 		 1137 aa  364  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  41.67 
 
 		 1137 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  38.86 
 
 		 1115 aa  363  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  35.18 
 
 		 1133 aa  361  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  38.45 
 
 		 1130 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  37.66 
 
 		 1113 aa  353  8e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  40.5 
 
 		 1126 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  38.72 
 
 		 1138 aa  350  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  37.52 
 
 		 1137 aa  350  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  37.67 
 
 		 1108 aa  342  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  56.04 
 
 		 505 aa  340  7e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  38.05 
 
 		 1119 aa  340  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  37.04 
 
 		 1129 aa  337  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  44.44 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  36.33 
 
 		 1233 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  43.21 
 
 		 544 aa  333  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  42.13 
 
 		 506 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  53.27 
 
 		 544 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  53.44 
 
 		 544 aa  326  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  53.55 
 
 		 513 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  35.74 
 
 		 1141 aa  323  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  46.84 
 
 		 527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  53.64 
 
 		 508 aa  316  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  53.54 
 
 		 499 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  53.31 
 
 		 517 aa  309  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  50.17 
 
 		 489 aa  303  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.72 
 
 		 504 aa  300  9e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  33.86 
 
 		 753 aa  298  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  50.16 
 
 		 484 aa  297  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  40.93 
 
 		 516 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  52.03 
 
 		 493 aa  279  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.64 
 
 		 548 aa  278  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  37.82 
 
 		 540 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  47.7 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  42.16 
 
 		 513 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  46.82 
 
 		 554 aa  270  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  43.14 
 
 		 512 aa  270  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  39.18 
 
 		 524 aa  270  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3394  putative restriction modification enzyme R subunit protein  32.99 
 
 		 954 aa  268  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  46.05 
 
 		 553 aa  268  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  44.95 
 
 		 579 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  46.38 
 
 		 553 aa  267  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  45.48 
 
 		 506 aa  261  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  38.64 
 
 		 563 aa  261  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  38.67 
 
 		 481 aa  238  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  39.83 
 
 		 818 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  38.18 
 
 		 549 aa  214  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  39.03 
 
 		 775 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.56 
 
 		 1080 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 		 893 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  38.34 
 
 		 846 aa  197  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  29.07 
 
 		 583 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.5 
 
 		 1126 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.9 
 
 		 1068 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  35.48 
 
 		 494 aa  193  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.97 
 
 		 1082 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  29.35 
 
 		 921 aa  192  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  31.06 
 
 		 1174 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.93 
 
 		 1124 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.88 
 
 		 1137 aa  188  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.29 
 
 		 1068 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.98 
 
 		 1157 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  29.71 
 
 		 931 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 899 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 		 492 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  37.94 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  28.81 
 
 		 846 aa  179  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  27.5 
 
 		 875 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  28.31 
 
 		 924 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  27.63 
 
 		 899 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 889 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  27.08 
 
 		 797 aa  174  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 845 aa  174  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  29.13 
 
 		 925 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  34.42 
 
 		 490 aa  170  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  29.17 
 
 		 783 aa  170  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 776 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  29.03 
 
 		 793 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  27.71 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  27.19 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  30.46 
 
 		 790 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  29.2 
 
 		 780 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.73 
 
 		 1167 aa  168  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  33.24 
 
 		 503 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  28.21 
 
 		 917 aa  167  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>