More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20230 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  56.63 
 
 
787 aa  896    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  54.76 
 
 
784 aa  832    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  52.47 
 
 
761 aa  824    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  56.48 
 
 
800 aa  876    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  54.76 
 
 
784 aa  832    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  53.44 
 
 
813 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  52.97 
 
 
811 aa  855    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  57.78 
 
 
788 aa  920    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  54.92 
 
 
776 aa  875    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  58.17 
 
 
796 aa  931    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  53.12 
 
 
817 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  58.61 
 
 
793 aa  928    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  51.83 
 
 
824 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  53.68 
 
 
824 aa  850    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  54.32 
 
 
810 aa  846    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  52.86 
 
 
829 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  54.38 
 
 
793 aa  863    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  52.57 
 
 
783 aa  808    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  53.4 
 
 
821 aa  845    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  51.05 
 
 
815 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  52.68 
 
 
827 aa  829    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  52.82 
 
 
809 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  44.57 
 
 
796 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  53.43 
 
 
825 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  58.48 
 
 
780 aa  885    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  58.58 
 
 
790 aa  923    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  100 
 
 
770 aa  1580    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  51.05 
 
 
815 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  57.18 
 
 
791 aa  904    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  53.07 
 
 
780 aa  805    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  50.59 
 
 
765 aa  793    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  43.91 
 
 
790 aa  634  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  43.32 
 
 
791 aa  634  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  40.57 
 
 
769 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  37.25 
 
 
771 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  35.92 
 
 
770 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  34.13 
 
 
760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  35.81 
 
 
776 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  34.21 
 
 
760 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  32.12 
 
 
899 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  35.32 
 
 
804 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  34 
 
 
783 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  33.86 
 
 
811 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  40.48 
 
 
802 aa  362  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  34.61 
 
 
797 aa  360  7e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  31.58 
 
 
860 aa  352  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  37.78 
 
 
875 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  36.76 
 
 
899 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  36.1 
 
 
583 aa  324  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  32.31 
 
 
787 aa  303  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  30.02 
 
 
753 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  30.11 
 
 
889 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  29.73 
 
 
1108 aa  184  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  29.38 
 
 
1113 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.29 
 
 
1188 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.59 
 
 
1082 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 
912 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  31.38 
 
 
1129 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 
1137 aa  170  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  29.09 
 
 
1115 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  28.16 
 
 
1170 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.55 
 
 
1124 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28 
 
 
1080 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.75 
 
 
1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  29.69 
 
 
1119 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  27.57 
 
 
907 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.08 
 
 
1137 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.84 
 
 
1169 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.32 
 
 
1174 aa  158  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  29.51 
 
 
1141 aa  157  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.49 
 
 
1126 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 
1130 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.29 
 
 
1167 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.97 
 
 
1157 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 
933 aa  155  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  28.36 
 
 
932 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  27.79 
 
 
945 aa  153  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 
1005 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  28.31 
 
 
932 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  27.72 
 
 
1138 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  38.08 
 
 
546 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  27.12 
 
 
936 aa  145  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  30.96 
 
 
1131 aa  145  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 
1115 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  27.29 
 
 
934 aa  144  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 
936 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 
1125 aa  141  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.63 
 
 
1068 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  26.26 
 
 
1233 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.9 
 
 
1068 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  29.57 
 
 
846 aa  137  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 
931 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 
1126 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 
1138 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  26.52 
 
 
845 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  26.61 
 
 
1137 aa  131  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 
1137 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 
1133 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  26.97 
 
 
1137 aa  130  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 
1137 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>