232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2088 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  100 
 
 		 546 aa  1117    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  89.19 
 
 		 875 aa  998    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  55.21 
 
 		 899 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  56.16 
 
 		 899 aa  588  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  74.89 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  32.49 
 
 		 790 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  32.49 
 
 		 791 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  29.64 
 
 		 829 aa  210  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  29.56 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  29.35 
 
 		 810 aa  207  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  28.88 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  29.01 
 
 		 824 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  27.92 
 
 		 800 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  28.28 
 
 		 821 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  29.53 
 
 		 796 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  29.09 
 
 		 827 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  29.56 
 
 		 817 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 860 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  39.84 
 
 		 796 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.59 
 
 		 813 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  27.35 
 
 		 811 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  36.33 
 
 		 770 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  35.88 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  37.17 
 
 		 804 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  36.23 
 
 		 802 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  35.79 
 
 		 776 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  38.08 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  36.19 
 
 		 761 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  35.11 
 
 		 760 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  34.56 
 
 		 760 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  34.73 
 
 		 783 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  36.9 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  36.9 
 
 		 815 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  35.42 
 
 		 783 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  35.77 
 
 		 797 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  36.74 
 
 		 811 aa  140  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  37.25 
 
 		 784 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  37.25 
 
 		 784 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  37.97 
 
 		 765 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  33.79 
 
 		 787 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  34.86 
 
 		 787 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  34.22 
 
 		 824 aa  137  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  34.6 
 
 		 791 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  34.35 
 
 		 780 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  34.66 
 
 		 788 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  35.47 
 
 		 793 aa  133  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  33.08 
 
 		 793 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  35.09 
 
 		 776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  34.92 
 
 		 790 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  33.04 
 
 		 769 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  26.89 
 
 		 1113 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  25.95 
 
 		 1108 aa  93.6  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  26.71 
 
 		 893 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.27 
 
 		 1174 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.29 
 
 		 1167 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.74 
 
 		 1068 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  31.15 
 
 		 1068 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.56 
 
 		 1169 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 889 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.63 
 
 		 1157 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.08 
 
 		 1080 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.31 
 
 		 1188 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.57 
 
 		 1124 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 907 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  29.01 
 
 		 1170 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.39 
 
 		 1169 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.77 
 
 		 1126 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28 
 
 		 1137 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1131 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  28.51 
 
 		 912 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25.47 
 
 		 1115 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 931 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 1005 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  23.57 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  24.92 
 
 		 1137 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 1138 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  23.86 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  25.7 
 
 		 945 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  26.24 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  24.56 
 
 		 917 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 1137 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.91 
 
 		 1082 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  27.31 
 
 		 1137 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 1137 aa  72.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 1137 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  24.55 
 
 		 1125 aa  70.5  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  25.62 
 
 		 1233 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2408  type III restriction enzyme, res subunit  24.68 
 
 		 907 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1133 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3779  type III restriction enzyme, res subunit  25.11 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.7 
 
 		 1077 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3852  type III restriction enzyme, res subunit  25.11 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.345387  normal  0.793201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  23.95 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  24.69 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  23.68 
 
 		 936 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 		 1119 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  34.71 
 
 		 1418 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  24.1 
 
 		 1130 aa  66.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>