More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1993 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  37.7 
 
 
1170 aa  783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  40.72 
 
 
1137 aa  885    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  44.87 
 
 
1124 aa  966    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  53.23 
 
 
1068 aa  1161    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  38.54 
 
 
1169 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  39.75 
 
 
1188 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  53.23 
 
 
1068 aa  1158    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  44.56 
 
 
1126 aa  960    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  40.55 
 
 
1157 aa  847    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  100 
 
 
1082 aa  2221    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  40.27 
 
 
1167 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  61.08 
 
 
1080 aa  1397    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  39.18 
 
 
1174 aa  813    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  38.04 
 
 
1169 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  34.34 
 
 
889 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  29.9 
 
 
893 aa  396  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  27.85 
 
 
931 aa  279  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  28.16 
 
 
917 aa  278  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 
1133 aa  260  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  26.87 
 
 
921 aa  260  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  27.26 
 
 
918 aa  258  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  29.4 
 
 
1137 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  26.21 
 
 
919 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 
924 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  28.94 
 
 
1138 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  29.53 
 
 
1131 aa  241  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 
925 aa  240  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 
1137 aa  237  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 
1137 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 
1137 aa  235  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  27.91 
 
 
1126 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  30.41 
 
 
1113 aa  230  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  29.23 
 
 
1108 aa  222  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 
1138 aa  220  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 
1130 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  28.52 
 
 
1115 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2408  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 
907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  28.81 
 
 
1125 aa  216  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3779  type III restriction enzyme, res subunit  29.42 
 
 
803 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3852  type III restriction enzyme, res subunit  29.42 
 
 
803 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.345387  normal  0.793201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  28.73 
 
 
1137 aa  214  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 
1233 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 
1119 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  30.24 
 
 
1115 aa  210  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  28.69 
 
 
934 aa  208  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  26.01 
 
 
1129 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 
1005 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  26.51 
 
 
1141 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  28.84 
 
 
936 aa  187  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  28.68 
 
 
907 aa  187  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 
912 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  28.62 
 
 
933 aa  184  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  28.46 
 
 
760 aa  179  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  28.46 
 
 
760 aa  177  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  28.32 
 
 
932 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.63 
 
 
804 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  27.97 
 
 
936 aa  175  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  28.66 
 
 
802 aa  173  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  29.32 
 
 
800 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  28.59 
 
 
770 aa  172  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  28.34 
 
 
825 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  28.59 
 
 
790 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  28.64 
 
 
811 aa  171  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  28.32 
 
 
797 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  28.9 
 
 
809 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  27.98 
 
 
932 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  28.41 
 
 
793 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  27.39 
 
 
780 aa  168  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  27.5 
 
 
824 aa  167  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  27.29 
 
 
810 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 
945 aa  167  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  29.36 
 
 
821 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.46 
 
 
813 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  28.71 
 
 
753 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  28.6 
 
 
780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  26.09 
 
 
829 aa  165  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  28.71 
 
 
765 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  28.35 
 
 
776 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  27.84 
 
 
791 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  27.26 
 
 
771 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  27.87 
 
 
783 aa  162  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  26.69 
 
 
796 aa  162  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  26.26 
 
 
761 aa  162  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  25.55 
 
 
815 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  27.33 
 
 
583 aa  160  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  28.13 
 
 
770 aa  159  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  27.05 
 
 
783 aa  159  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  26.71 
 
 
788 aa  159  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  25.31 
 
 
815 aa  158  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  27.05 
 
 
787 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  27.03 
 
 
793 aa  155  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  27.35 
 
 
824 aa  154  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  26.61 
 
 
784 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  26.61 
 
 
784 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  28.27 
 
 
796 aa  153  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  26.38 
 
 
899 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  28.4 
 
 
827 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  26.37 
 
 
790 aa  149  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  26.9 
 
 
811 aa  149  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  28.4 
 
 
817 aa  148  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>