254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1018 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  43.62 
 
 		 784 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  43.62 
 
 		 784 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  45.79 
 
 		 787 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  45.14 
 
 		 790 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  61.7 
 
 		 827 aa  987    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  45.3 
 
 		 811 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  46.11 
 
 		 788 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  45.23 
 
 		 776 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  47.56 
 
 		 796 aa  740    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  46.87 
 
 		 793 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  44.79 
 
 		 800 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  44.77 
 
 		 765 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  44.1 
 
 		 810 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  43.81 
 
 		 821 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  45.38 
 
 		 793 aa  680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  44.87 
 
 		 815 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  42.3 
 
 		 824 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  46.93 
 
 		 791 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  41.87 
 
 		 825 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  42.55 
 
 		 809 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  44.7 
 
 		 813 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  61.07 
 
 		 824 aa  970    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  62.59 
 
 		 817 aa  995    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 769 aa  1592    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  44.74 
 
 		 815 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  41.01 
 
 		 829 aa  631  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  42.36 
 
 		 780 aa  622  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  42.53 
 
 		 783 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  40.57 
 
 		 770 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  39.8 
 
 		 761 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  37 
 
 		 791 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  35.8 
 
 		 790 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  35.75 
 
 		 796 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  32.48 
 
 		 771 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  32.29 
 
 		 776 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  30.39 
 
 		 770 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  31.59 
 
 		 760 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 		 760 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  31.05 
 
 		 811 aa  310  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  30.84 
 
 		 802 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  30.89 
 
 		 804 aa  302  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  31.22 
 
 		 783 aa  301  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  32.68 
 
 		 860 aa  284  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  28.32 
 
 		 797 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  31.13 
 
 		 899 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  30.36 
 
 		 875 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  29.54 
 
 		 899 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 787 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 583 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  46.15 
 
 		 780 aa  142  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.66 
 
 		 1169 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.46 
 
 		 1169 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.43 
 
 		 1188 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 1005 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.69 
 
 		 1080 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  25.31 
 
 		 889 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.62 
 
 		 1157 aa  130  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  28.06 
 
 		 1170 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.52 
 
 		 1082 aa  125  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  27.2 
 
 		 1108 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  27.85 
 
 		 1115 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  27.46 
 
 		 1113 aa  122  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.88 
 
 		 1174 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 		 907 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 1125 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.83 
 
 		 1137 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  24.96 
 
 		 933 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  26.03 
 
 		 753 aa  118  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.37 
 
 		 1167 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.37 
 
 		 1068 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 1129 aa  117  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  29 
 
 		 1130 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  28.13 
 
 		 1119 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.89 
 
 		 1124 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  27.01 
 
 		 932 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.42 
 
 		 1068 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  26.81 
 
 		 932 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  26.31 
 
 		 936 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  33.04 
 
 		 546 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  23.99 
 
 		 936 aa  110  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.24 
 
 		 1126 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  22.72 
 
 		 912 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  25.84 
 
 		 1137 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  26.85 
 
 		 1137 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  25.11 
 
 		 1233 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  25.66 
 
 		 1137 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  24.92 
 
 		 1137 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  25.74 
 
 		 1115 aa  101  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  23.24 
 
 		 934 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  26.31 
 
 		 931 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 1138 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  25.87 
 
 		 1138 aa  97.8  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1131 aa  97.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  26.33 
 
 		 945 aa  97.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  27.89 
 
 		 558 aa  94.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  25.17 
 
 		 1133 aa  93.2  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 1137 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  24.64 
 
 		 919 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 		 893 aa  90.1  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3779  type III restriction enzyme, res subunit  23.97 
 
 		 803 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>