More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3738 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  39.21 
 
 		 1055 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  38.69 
 
 		 1041 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  39.02 
 
 		 1055 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  38.95 
 
 		 1017 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  40.49 
 
 		 982 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  44.59 
 
 		 1033 aa  755    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.75 
 
 		 1031 aa  857    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  37.75 
 
 		 1042 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  38.81 
 
 		 1065 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  56.72 
 
 		 1029 aa  1103    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  45.26 
 
 		 1033 aa  778    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  39.3 
 
 		 1051 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  47.77 
 
 		 1051 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1035 aa  2093    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  39.4 
 
 		 1061 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  47.28 
 
 		 1028 aa  856    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  46.01 
 
 		 1063 aa  854    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  39.91 
 
 		 1058 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  42.42 
 
 		 1066 aa  686    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  41.47 
 
 		 1062 aa  734    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  36.69 
 
 		 1052 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  37.79 
 
 		 1042 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  48.66 
 
 		 1033 aa  901    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  39.23 
 
 		 1055 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  39.83 
 
 		 1043 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  29.16 
 
 		 993 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  32.94 
 
 		 938 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  32.7 
 
 		 956 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  32.96 
 
 		 928 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.87 
 
 		 974 aa  332  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  37.09 
 
 		 1077 aa  332  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  37.48 
 
 		 1287 aa  330  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  30.56 
 
 		 905 aa  326  1e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  35.09 
 
 		 848 aa  323  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  32.78 
 
 		 813 aa  303  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  35.8 
 
 		 1418 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  27.28 
 
 		 953 aa  301  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  27.28 
 
 		 953 aa  301  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  33.44 
 
 		 967 aa  299  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  33.89 
 
 		 815 aa  298  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.54 
 
 		 979 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  34.2 
 
 		 987 aa  295  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  29.71 
 
 		 1149 aa  290  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  32.86 
 
 		 979 aa  287  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  31.4 
 
 		 812 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  30.44 
 
 		 946 aa  285  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  30.23 
 
 		 952 aa  283  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  34.58 
 
 		 1348 aa  271  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  29.9 
 
 		 949 aa  260  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  33.28 
 
 		 980 aa  252  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.95 
 
 		 967 aa  243  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  30.05 
 
 		 949 aa  240  9e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  31.42 
 
 		 773 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  32.54 
 
 		 558 aa  158  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  33.88 
 
 		 475 aa  146  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  30.03 
 
 		 385 aa  143  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  30.17 
 
 		 459 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 556 aa  137  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  34.05 
 
 		 581 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 		 462 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.44 
 
 		 643 aa  132  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 		 536 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.4 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.88 
 
 		 606 aa  129  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.51 
 
 		 607 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  33.74 
 
 		 524 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 776 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  30 
 
 		 706 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.59 
 
 		 560 aa  117  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 899 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 629 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 		 560 aa  114  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 804 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  30.81 
 
 		 545 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  28.17 
 
 		 761 aa  112  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  30.81 
 
 		 545 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 		 760 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  27.27 
 
 		 760 aa  112  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  26.92 
 
 		 811 aa  111  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 398 aa  111  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 		 545 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.71 
 
 		 560 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  30.09 
 
 		 550 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 569 aa  108  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  28.27 
 
 		 583 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  24.76 
 
 		 797 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  27.67 
 
 		 597 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.12 
 
 		 560 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  30.08 
 
 		 824 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  30.42 
 
 		 586 aa  106  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 		 586 aa  106  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  28.49 
 
 		 583 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.7 
 
 		 813 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 585 aa  105  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 538 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  28.68 
 
 		 809 aa  105  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  25.55 
 
 		 875 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>