More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2574 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  95.39 
 
 		 586 aa  1170    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  78.6 
 
 		 585 aa  977    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  95.39 
 
 		 586 aa  1170    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  54.53 
 
 		 602 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  89.59 
 
 		 586 aa  1106    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  95.39 
 
 		 586 aa  1170    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  77.99 
 
 		 586 aa  972    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  77.82 
 
 		 586 aa  973    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  57.07 
 
 		 574 aa  686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  100 
 
 		 586 aa  1217    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  54.23 
 
 		 590 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  95.22 
 
 		 586 aa  1167    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  55.06 
 
 		 584 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  57.83 
 
 		 583 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  78.08 
 
 		 585 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  99.66 
 
 		 586 aa  1213    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  77.33 
 
 		 591 aa  968    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  100 
 
 		 586 aa  1217    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  95.39 
 
 		 586 aa  1170    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  95.22 
 
 		 586 aa  1169    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  57.8 
 
 		 583 aa  713    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  62.46 
 
 		 613 aa  738    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  53.11 
 
 		 597 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  53.97 
 
 		 590 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  53.97 
 
 		 590 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  54.5 
 
 		 583 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  78.08 
 
 		 585 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  99.66 
 
 		 586 aa  1213    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  54.76 
 
 		 584 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  54.31 
 
 		 590 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  76.62 
 
 		 586 aa  960    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  99.66 
 
 		 586 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  95.22 
 
 		 586 aa  1168    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.69 
 
 		 657 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  54.96 
 
 		 584 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  78.08 
 
 		 585 aa  976    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  54.42 
 
 		 584 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  59.39 
 
 		 585 aa  713    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  95.05 
 
 		 586 aa  1167    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  54.42 
 
 		 584 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  54.45 
 
 		 586 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  53.53 
 
 		 579 aa  631  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  52.14 
 
 		 616 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  55.69 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  52.78 
 
 		 580 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  51.39 
 
 		 580 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  52.15 
 
 		 580 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  34.5 
 
 		 678 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  35.96 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  35.54 
 
 		 550 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  34.65 
 
 		 545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  36.19 
 
 		 569 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 545 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  34.16 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31.01 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  31.81 
 
 		 629 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  33.06 
 
 		 536 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  32.01 
 
 		 606 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.47 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  31 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  32.45 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.56 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  31.1 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  30.56 
 
 		 560 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.27 
 
 		 643 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  30.54 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.5 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.04 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 556 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 812 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 		 1066 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  28.87 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 		 967 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 848 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 1058 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  30.13 
 
 		 558 aa  107  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  26.17 
 
 		 824 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.21 
 
 		 706 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 1287 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.49 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  28.07 
 
 		 1418 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  30.13 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.45 
 
 		 773 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  30.08 
 
 		 1348 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.53 
 
 		 974 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  27.9 
 
 		 1053 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.82 
 
 		 949 aa  100  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 		 1077 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  27.86 
 
 		 938 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 967 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 815 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.25 
 
 		 783 aa  97.4  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  25.41 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>