More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2849 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 512 aa  1060    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  63.95 
 
 		 503 aa  664    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  52.67 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  34.02 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.55 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.75 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 		 560 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.19 
 
 		 560 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.19 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 569 aa  123  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.08 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.34 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.33 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  26.78 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.35 
 
 		 773 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  25.88 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  27.18 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.82 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  26.27 
 
 		 574 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  26.6 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  27.95 
 
 		 607 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  26.88 
 
 		 583 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  26.88 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  26.77 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  27.19 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 813 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.99 
 
 		 967 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  27.06 
 
 		 616 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  27.02 
 
 		 815 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 602 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  25.98 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.73 
 
 		 657 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  30.03 
 
 		 905 aa  98.2  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.66 
 
 		 580 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  28.17 
 
 		 1052 aa  97.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 584 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  25.57 
 
 		 584 aa  97.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  25.43 
 
 		 584 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  25.88 
 
 		 590 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  26.45 
 
 		 502 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  25.72 
 
 		 584 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  25.43 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 		 946 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.81 
 
 		 590 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  25.81 
 
 		 590 aa  94  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 1051 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  25.41 
 
 		 590 aa  94  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 585 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  26.73 
 
 		 1063 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  25.23 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.73 
 
 		 1031 aa  90.5  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  26.11 
 
 		 586 aa  90.1  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 1055 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 1287 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  24.53 
 
 		 585 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  22.81 
 
 		 613 aa  88.6  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  24.53 
 
 		 585 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  24.53 
 
 		 585 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  27.22 
 
 		 949 aa  87.8  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 586 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  26.81 
 
 		 982 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 1348 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  24.68 
 
 		 591 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  26.75 
 
 		 949 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 		 1043 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.35 
 
 		 1053 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.85 
 
 		 974 aa  84.7  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 1055 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 		 1055 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  25.51 
 
 		 761 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  27.8 
 
 		 770 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.59 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.47 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 597 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.47 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.59 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 		 1418 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.59 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  24.65 
 
 		 1033 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>