More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0773 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 463 aa  925    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  74.95 
 
 		 485 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  75.16 
 
 		 485 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  67.34 
 
 		 479 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  66.37 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  66.59 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  65.63 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  35.02 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  28.54 
 
 		 998 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  30 
 
 		 796 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 652 aa  155  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  27.63 
 
 		 778 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  31.01 
 
 		 654 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.43 
 
 		 647 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 784 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 809 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  28.38 
 
 		 809 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.73 
 
 		 491 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  32.07 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.85 
 
 		 920 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  30.21 
 
 		 796 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  28.76 
 
 		 799 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 788 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 971 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 795 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  29.18 
 
 		 768 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.85 
 
 		 815 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.17 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 794 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 785 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.81 
 
 		 925 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  27.23 
 
 		 786 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  30.89 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  28.93 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.23 
 
 		 967 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  26.12 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.75 
 
 		 531 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.96 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 813 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  37.5 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 813 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.44 
 
 		 629 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  28.04 
 
 		 773 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  36.93 
 
 		 451 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  27.75 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 		 590 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.2 
 
 		 555 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.78 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.01 
 
 		 643 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.44 
 
 		 479 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.37 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  27.35 
 
 		 548 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  28.49 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 		 649 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  27.97 
 
 		 606 aa  103  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  28.25 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  28.37 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  24.64 
 
 		 818 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.99 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  30.58 
 
 		 1348 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.45 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  36.84 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  36.26 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.32 
 
 		 602 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.08 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.17 
 
 		 720 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.89 
 
 		 905 aa  98.2  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  27.42 
 
 		 555 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  25.78 
 
 		 949 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  21.98 
 
 		 993 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  29.59 
 
 		 479 aa  96.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 		 946 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  24.2 
 
 		 1053 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 550 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.81 
 
 		 953 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  27.9 
 
 		 548 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 1029 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 953 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  27.45 
 
 		 558 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.12 
 
 		 952 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 812 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 		 548 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.35 
 
 		 558 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  31.89 
 
 		 524 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.52 
 
 		 813 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>