More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0708 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  95.41 
 
 		 479 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  96.03 
 
 		 479 aa  890    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  75.57 
 
 		 485 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 479 aa  946    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  75.78 
 
 		 485 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  97.91 
 
 		 479 aa  928    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  66.37 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  36.66 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  30.38 
 
 		 998 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  30.24 
 
 		 796 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.22 
 
 		 652 aa  163  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  34.1 
 
 		 647 aa  163  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.51 
 
 		 650 aa  161  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  31.08 
 
 		 799 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  31.13 
 
 		 654 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  29.72 
 
 		 809 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  29.72 
 
 		 809 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  31.66 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.7 
 
 		 778 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  31.35 
 
 		 796 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  27.55 
 
 		 786 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  30.59 
 
 		 795 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  27.42 
 
 		 971 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.08 
 
 		 531 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  28.81 
 
 		 813 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  28.81 
 
 		 813 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.46 
 
 		 491 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.7 
 
 		 925 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  30.18 
 
 		 768 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 		 788 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 815 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  27.75 
 
 		 920 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 784 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  31.09 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  29.98 
 
 		 785 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.14 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.64 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 466 aa  127  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  28.14 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.46 
 
 		 558 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  36.84 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.3 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  27.49 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  37.57 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.54 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  27.72 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 550 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  29.81 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 509 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 509 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 967 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.61 
 
 		 629 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  30.28 
 
 		 773 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 		 559 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  27.98 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.49 
 
 		 558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 581 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.53 
 
 		 602 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  27.76 
 
 		 549 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  28.14 
 
 		 558 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  27.71 
 
 		 630 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.43 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.23 
 
 		 550 aa  110  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 551 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.61 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25.5 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  29.09 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  25.71 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 666 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.07 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  26.26 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  26.92 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  26.68 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  25 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 		 556 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.47 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  30.52 
 
 		 630 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  29.7 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.27 
 
 		 479 aa  103  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 953 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 953 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  30.49 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  27.17 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 590 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>