229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1457 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  47.76 
 
 		 815 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 971 aa  2003    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  45.63 
 
 		 925 aa  730    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.2 
 
 		 998 aa  657    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  45.09 
 
 		 799 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  45.14 
 
 		 809 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  45.14 
 
 		 809 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  45.62 
 
 		 785 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  45.73 
 
 		 813 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  42.3 
 
 		 788 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  43.61 
 
 		 784 aa  698    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  44.63 
 
 		 796 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  45.73 
 
 		 813 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  45.02 
 
 		 786 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  46.14 
 
 		 768 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  45.61 
 
 		 794 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  44.81 
 
 		 795 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  43.7 
 
 		 796 aa  613  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  40.83 
 
 		 778 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  34.62 
 
 		 920 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.35 
 
 		 455 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.42 
 
 		 479 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 479 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  26.81 
 
 		 479 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  43.45 
 
 		 154 aa  134  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 463 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 		 485 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  26 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  29.35 
 
 		 279 aa  127  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  24.34 
 
 		 473 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  45.3 
 
 		 195 aa  101  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  31.46 
 
 		 444 aa  90.5  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.53 
 
 		 1041 aa  89.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.95 
 
 		 443 aa  84  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  28.01 
 
 		 1017 aa  77.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.3 
 
 		 654 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 499 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.47 
 
 		 456 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  25.7 
 
 		 1058 aa  75.5  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.42 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.74 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.13 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 1055 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 466 aa  74.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 666 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.59 
 
 		 647 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.17 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 1055 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 1348 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 		 1061 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.28 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  22.67 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  23.76 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  24.14 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.46 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  26.74 
 
 		 982 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.6 
 
 		 630 aa  70.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 494 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  27.53 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  28.87 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  26.94 
 
 		 1051 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  28.87 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  21.76 
 
 		 815 aa  67.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  24.16 
 
 		 581 aa  67.4  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  25.96 
 
 		 1033 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.57 
 
 		 1077 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.77 
 
 		 1043 aa  67  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  25.28 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5882  helicase domain protein  24.85 
 
 		 1169 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  23.25 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  25.96 
 
 		 1033 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  23.56 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.54 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  25.35 
 
 		 1062 aa  64.7  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  22.16 
 
 		 979 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 658 aa  63.9  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.52 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  25.18 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.41 
 
 		 548 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  28.04 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  21.66 
 
 		 967 aa  63.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.7 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  26.94 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  23.22 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  23.65 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>