46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1533 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1533  helicase  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  78.01 
 
 		 809 aa  233  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  78.01 
 
 		 809 aa  233  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  75.35 
 
 		 788 aa  231  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  72.97 
 
 		 784 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  68.28 
 
 		 799 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  67.38 
 
 		 786 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  67.35 
 
 		 796 aa  209  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  63.89 
 
 		 768 aa  200  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  62.5 
 
 		 795 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  63.38 
 
 		 794 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  43.05 
 
 		 925 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  43.45 
 
 		 971 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  45.77 
 
 		 815 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  46.81 
 
 		 778 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  44.52 
 
 		 785 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  44.83 
 
 		 813 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  44.83 
 
 		 813 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  48.59 
 
 		 796 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  37.76 
 
 		 920 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  38.73 
 
 		 998 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  46.46 
 
 		 279 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  36.59 
 
 		 455 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  35.61 
 
 		 463 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  35.88 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  35.88 
 
 		 479 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 398 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  35.88 
 
 		 485 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  36.15 
 
 		 479 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  35.88 
 
 		 485 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 560 aa  53.9  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 560 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 560 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 560 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  35.88 
 
 		 479 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 560 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 560 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  28.06 
 
 		 531 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 		 581 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 1031 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.19 
 
 		 773 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 586 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 1058 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 969 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.17 
 
 		 462 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 569 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>