299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0307 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  49.61 
 
 		 813 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  58.92 
 
 		 795 aa  966    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  46.45 
 
 		 925 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  49.61 
 
 		 813 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  66.2 
 
 		 799 aa  1043    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  71.32 
 
 		 786 aa  1163    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  59.67 
 
 		 794 aa  967    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  44.56 
 
 		 796 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  84.1 
 
 		 788 aa  1340    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  51.88 
 
 		 815 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 784 aa  1605    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  78.29 
 
 		 809 aa  1276    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  51.19 
 
 		 785 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  64.65 
 
 		 796 aa  1039    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  43.61 
 
 		 971 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  78.29 
 
 		 809 aa  1276    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  70.3 
 
 		 768 aa  1108    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  44.15 
 
 		 778 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.75 
 
 		 998 aa  538  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  32.28 
 
 		 920 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  72.97 
 
 		 154 aa  230  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  77.78 
 
 		 195 aa  193  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.9 
 
 		 455 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.93 
 
 		 479 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 479 aa  134  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 485 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 485 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 479 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.48 
 
 		 560 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.91 
 
 		 560 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  47.37 
 
 		 279 aa  100  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  67.19 
 
 		 105 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.2 
 
 		 654 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  25.83 
 
 		 473 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 462 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 652 aa  90.1  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 		 647 aa  90.5  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  24.5 
 
 		 560 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  24.08 
 
 		 560 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 560 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  24.5 
 
 		 560 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  35.58 
 
 		 443 aa  88.2  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  24.5 
 
 		 398 aa  87.4  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.53 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  36.25 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  34.67 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.6 
 
 		 773 aa  82  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  35 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 1055 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.93 
 
 		 1055 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 979 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.02 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 1348 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  26.02 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  26.02 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  26.44 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.02 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  34.76 
 
 		 658 aa  78.2  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  25.75 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.64 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 649 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.65 
 
 		 1055 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.43 
 
 		 815 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  38.22 
 
 		 499 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  26.56 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 812 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  26.56 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  35.44 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  26.56 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 1061 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.32 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.08 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  25.6 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  26.56 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  28.74 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.6 
 
 		 974 aa  74.7  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.14 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  26.56 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  29.39 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  28.45 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  25.47 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  26.08 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  36.88 
 
 		 531 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  24.58 
 
 		 536 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  30.33 
 
 		 550 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.98 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>