215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3271 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  51.19 
 
 		 784 aa  745    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  52.37 
 
 		 925 aa  875    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  50.98 
 
 		 788 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  52.07 
 
 		 799 aa  766    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  51.25 
 
 		 809 aa  741    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  51.25 
 
 		 809 aa  741    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  49.87 
 
 		 795 aa  763    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 785 aa  1590    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  48.12 
 
 		 794 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  52.46 
 
 		 796 aa  767    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  57.29 
 
 		 813 aa  873    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  52.12 
 
 		 768 aa  774    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  56.46 
 
 		 815 aa  847    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  47.26 
 
 		 786 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  44.06 
 
 		 796 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  57.29 
 
 		 813 aa  873    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  46.14 
 
 		 971 aa  733    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  43.5 
 
 		 778 aa  618  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  42.84 
 
 		 998 aa  597  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  31.08 
 
 		 920 aa  389  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  31.62 
 
 		 455 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  63.25 
 
 		 195 aa  144  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  31.18 
 
 		 479 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.96 
 
 		 479 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  31.32 
 
 		 479 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  31.1 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  45.45 
 
 		 154 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.2 
 
 		 485 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.89 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 		 473 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  50.57 
 
 		 279 aa  96.3  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  29.5 
 
 		 654 aa  81.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  36.84 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  35.12 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  28.64 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  32.77 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  35.85 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  36.48 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.57 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  35.17 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  30.58 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  29.74 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.01 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  32.2 
 
 		 440 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 658 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  30.68 
 
 		 517 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.11 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  29.23 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  31.18 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  34.59 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.05 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  32.94 
 
 		 444 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  33.13 
 
 		 451 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  33.73 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  32.1 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.66 
 
 		 1077 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  32.52 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  31.74 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.16 
 
 		 813 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  33.13 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  24.78 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  25.28 
 
 		 1066 aa  64.3  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  29.65 
 
 		 468 aa  63.9  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.74 
 
 		 462 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.82 
 
 		 550 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  23.89 
 
 		 536 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  23.88 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  27.54 
 
 		 607 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  33.11 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 812 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.93 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 548 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 1348 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.53 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.18 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  24.77 
 
 		 938 aa  61.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  23.72 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.12 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.39 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  25.73 
 
 		 606 aa  60.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 666 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 1033 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  25.84 
 
 		 928 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 1055 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 1055 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  26.88 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.25 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.11 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  27.09 
 
 		 1033 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  35.51 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  25.61 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.33 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>