More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1032 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  75.78 
 
 
485 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  94.57 
 
 
479 aa  894    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  75.78 
 
 
485 aa  685    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  95.2 
 
 
479 aa  877    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  95.41 
 
 
479 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
479 aa  945    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  65.63 
 
 
463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  36.43 
 
 
455 aa  240  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  31.21 
 
 
796 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  30.82 
 
 
998 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  30.95 
 
 
647 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  31.22 
 
 
799 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.82 
 
 
652 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  30.15 
 
 
809 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  30.15 
 
 
809 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.7 
 
 
778 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 
794 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  29.43 
 
 
654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  29.77 
 
 
650 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  31.5 
 
 
796 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  28.09 
 
 
786 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  29.45 
 
 
795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 
813 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 
813 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  26.81 
 
 
971 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 
815 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.75 
 
 
531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 
444 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  30.73 
 
 
788 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 
768 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.81 
 
 
925 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 
785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  30 
 
 
784 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  27.35 
 
 
491 aa  132  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  30.89 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.12 
 
 
466 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.49 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  26.65 
 
 
920 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.52 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 
451 aa  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  28.53 
 
 
548 aa  126  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.45 
 
 
443 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  29.8 
 
 
444 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.84 
 
 
555 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 
466 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  36.84 
 
 
451 aa  123  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  29.38 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  38.1 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.01 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.35 
 
 
548 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 
550 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  29.77 
 
 
488 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 
548 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 
629 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.77 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 
630 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  28.25 
 
 
554 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 
499 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.76 
 
 
558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  27.96 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  26.52 
 
 
590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  29.3 
 
 
773 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  26.8 
 
 
548 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
581 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 
551 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  27.76 
 
 
549 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  29.89 
 
 
630 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 
558 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25.24 
 
 
517 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 
649 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 
494 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.84 
 
 
967 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.61 
 
 
548 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 
509 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 
509 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 
666 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  28.84 
 
 
550 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  28.24 
 
 
462 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.61 
 
 
602 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  26.54 
 
 
555 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 
561 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 
531 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 
549 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 
549 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 
549 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  26.9 
 
 
548 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  26.15 
 
 
557 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 
479 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  26.59 
 
 
556 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  24.44 
 
 
564 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 
440 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  27.25 
 
 
548 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  26.62 
 
 
551 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 
590 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 
549 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 
953 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.59 
 
 
953 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  26.04 
 
 
546 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 
479 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>