289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0006 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  69.93 
 
 		 784 aa  1111    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  51.6 
 
 		 815 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  46.18 
 
 		 925 aa  717    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  45.15 
 
 		 796 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  62.94 
 
 		 799 aa  994    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.53 
 
 		 971 aa  703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  69.22 
 
 		 788 aa  1078    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  57.25 
 
 		 795 aa  931    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  64.01 
 
 		 786 aa  998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.71 
 
 		 813 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  52.12 
 
 		 785 aa  739    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  62.91 
 
 		 796 aa  999    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  67.37 
 
 		 809 aa  1057    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  58.02 
 
 		 794 aa  931    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  67.37 
 
 		 809 aa  1057    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 768 aa  1581    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.71 
 
 		 813 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  43.8 
 
 		 778 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.44 
 
 		 998 aa  541  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  32.25 
 
 		 920 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  63.89 
 
 		 154 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  77.78 
 
 		 195 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  31.16 
 
 		 455 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.82 
 
 		 479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.63 
 
 		 479 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 463 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.09 
 
 		 485 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  24.89 
 
 		 473 aa  104  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  46.81 
 
 		 279 aa  100  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 773 aa  99.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.67 
 
 		 560 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.94 
 
 		 560 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 560 aa  95.1  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 398 aa  94.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 560 aa  94.4  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.2 
 
 		 560 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  36.36 
 
 		 440 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 451 aa  92  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  28.52 
 
 		 649 aa  91.3  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 581 aa  90.5  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.55 
 
 		 974 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 		 444 aa  89  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.46 
 
 		 813 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.28 
 
 		 560 aa  88.2  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  35.44 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  26.24 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.23 
 
 		 815 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  29.85 
 
 		 1033 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  64.91 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  23.58 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.06 
 
 		 466 aa  84  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  38.1 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 		 967 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.28 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 1033 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.92 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 652 aa  81.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.33 
 
 		 1053 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  27.84 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  27.85 
 
 		 590 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 647 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  38.57 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.18 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  27.57 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  27.57 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  26.49 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  27.27 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  27.57 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  26.49 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.49 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  26.56 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  26.56 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  26.56 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  34.59 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  36.88 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  25.23 
 
 		 650 aa  77.8  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  27.3 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.22 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  27.59 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  27.13 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  24.27 
 
 		 654 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  37.87 
 
 		 658 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.99 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.47 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.63 
 
 		 1077 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  31.91 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  35.22 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  32.8 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  25.75 
 
 		 583 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  32.28 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>