222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1535 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 658 aa  1312    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  58.62 
 
 		 649 aa  728    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  59.16 
 
 		 630 aa  717    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  56.71 
 
 		 666 aa  739    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  37.74 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.45 
 
 		 555 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  36.94 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  38.43 
 
 		 548 aa  259  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  38.3 
 
 		 551 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  40.79 
 
 		 548 aa  256  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  35.88 
 
 		 548 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.25 
 
 		 558 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  36.53 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  38.58 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.19 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  35.74 
 
 		 549 aa  254  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  36.93 
 
 		 557 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  35.69 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  35.88 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  35.88 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  35.88 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  36.42 
 
 		 561 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  35.49 
 
 		 549 aa  248  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  39.86 
 
 		 602 aa  247  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  36.89 
 
 		 550 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  35.73 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  34.38 
 
 		 548 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  38.88 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  34.43 
 
 		 555 aa  243  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  35.69 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  39.07 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  29.81 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  39.07 
 
 		 551 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  38.82 
 
 		 548 aa  239  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  35.61 
 
 		 550 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 581 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  36.56 
 
 		 545 aa  237  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  34.9 
 
 		 545 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.48 
 
 		 548 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  29.67 
 
 		 838 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  29.44 
 
 		 818 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  33.96 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  30.48 
 
 		 866 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.64 
 
 		 720 aa  164  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 551 aa  163  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  29.45 
 
 		 440 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  27.23 
 
 		 781 aa  150  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  28.12 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  31.75 
 
 		 444 aa  142  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.63 
 
 		 444 aa  138  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 499 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.12 
 
 		 443 aa  136  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  33.09 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 488 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  33.57 
 
 		 652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.68 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  30.92 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  30.9 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.35 
 
 		 451 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  31.77 
 
 		 654 aa  130  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 470 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  35.9 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  28.82 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  33.69 
 
 		 647 aa  126  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.59 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 479 aa  125  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.29 
 
 		 456 aa  123  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  27.62 
 
 		 590 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  29.26 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  27.97 
 
 		 509 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  28.85 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 485 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.21 
 
 		 485 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.55 
 
 		 479 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.35 
 
 		 479 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 479 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.45 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 455 aa  93.2  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  35.5 
 
 		 809 aa  87.8  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  35.5 
 
 		 809 aa  87.8  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 489 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.18 
 
 		 633 aa  84  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  34.76 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 795 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  34.34 
 
 		 778 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  38.37 
 
 		 768 aa  83.2  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  35.33 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.17 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  34.12 
 
 		 794 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  34.1 
 
 		 886 aa  76.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>