214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1416 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  100 
 
 		 920 aa  1893    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  34.62 
 
 		 971 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  33.99 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  34.47 
 
 		 799 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  28.98 
 
 		 998 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  35.09 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  32.72 
 
 		 925 aa  416  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  35.25 
 
 		 794 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  33.67 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  32.28 
 
 		 784 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  33.64 
 
 		 796 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  32.64 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  32.64 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  32.03 
 
 		 788 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  32.25 
 
 		 768 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  32.08 
 
 		 813 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  32.08 
 
 		 813 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  32.21 
 
 		 815 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  30.2 
 
 		 785 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  30.22 
 
 		 778 aa  356  8.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  29.82 
 
 		 455 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25.85 
 
 		 463 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 479 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 479 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  26.48 
 
 		 485 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  26.26 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  37.76 
 
 		 154 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  25.57 
 
 		 279 aa  94.7  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 440 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  28.98 
 
 		 541 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  44.54 
 
 		 195 aa  91.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  27.15 
 
 		 551 aa  89  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  26.48 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 654 aa  81.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  28.18 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  22.06 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.45 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  25.91 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.89 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.73 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  27.06 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  25.39 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  25.65 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.5 
 
 		 650 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  25.79 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  26.75 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.82 
 
 		 555 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  25.74 
 
 		 451 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  23.65 
 
 		 647 aa  72  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  20.98 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  25.46 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.11 
 
 		 466 aa  70.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.54 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  23.17 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  24.37 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  24.79 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.84 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0066  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 1100 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  24.87 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  25.22 
 
 		 952 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  26.4 
 
 		 1061 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  24.86 
 
 		 1077 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.78 
 
 		 451 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 		 549 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 979 aa  67  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  26.78 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.58 
 
 		 813 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  23.89 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 1028 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  24.93 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  27.31 
 
 		 1051 aa  65.1  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  21.48 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.62 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 1116 aa  64.3  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.91 
 
 		 602 aa  64.3  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 509 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  22.84 
 
 		 815 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  25.51 
 
 		 1017 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.81 
 
 		 462 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  23.51 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  26.91 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  26.61 
 
 		 905 aa  62.4  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  25.81 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 1051 aa  62.4  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  23.2 
 
 		 643 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  23.73 
 
 		 479 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>