239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5449 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  47.84 
 
 		 794 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  51.25 
 
 		 925 aa  851    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 815 aa  1649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  50.44 
 
 		 799 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  50.2 
 
 		 809 aa  733    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  44.81 
 
 		 796 aa  667    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  48.16 
 
 		 971 aa  761    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  50.2 
 
 		 809 aa  733    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  56.46 
 
 		 785 aa  846    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  51.73 
 
 		 796 aa  763    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  60.05 
 
 		 813 aa  965    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  51.88 
 
 		 784 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  51.32 
 
 		 788 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  51.6 
 
 		 768 aa  772    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  48.04 
 
 		 786 aa  692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  49.34 
 
 		 795 aa  733    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  60.05 
 
 		 813 aa  965    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  40.32 
 
 		 778 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  42.07 
 
 		 998 aa  583  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  32.86 
 
 		 920 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  32.19 
 
 		 455 aa  196  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 		 479 aa  144  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 463 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 485 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 		 473 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  56.41 
 
 		 195 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  45.77 
 
 		 154 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.72 
 
 		 654 aa  107  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 		 647 aa  107  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  48.39 
 
 		 279 aa  102  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  31.8 
 
 		 652 aa  98.6  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  30.74 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  34.36 
 
 		 466 aa  90.1  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  34.36 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.42 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  38.26 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.45 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.37 
 
 		 548 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  33.72 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  32.82 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  34.15 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.59 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  32.31 
 
 		 456 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  33.54 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  30.86 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  32.37 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.65 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.07 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  33.09 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  23.97 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  25.46 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 1058 aa  74.3  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  23.26 
 
 		 560 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  23.26 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  32.29 
 
 		 451 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  31.6 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  24.4 
 
 		 560 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.63 
 
 		 444 aa  72  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  31.98 
 
 		 509 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  37.5 
 
 		 494 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  29.63 
 
 		 630 aa  72  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 590 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.78 
 
 		 974 aa  71.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  31.98 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.85 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 649 aa  70.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.94 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  30.22 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.09 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.48 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.06 
 
 		 905 aa  68.6  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  24.13 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.26 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 1348 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  33.2 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  34.13 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.59 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  35.29 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 581 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  33.79 
 
 		 499 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.19 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  25.99 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  31.84 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.59 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.14 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  23.88 
 
 		 967 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  24.66 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>