More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1556 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 470 aa  921    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  70.09 
 
 		 444 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  59.84 
 
 		 531 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  61.55 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  62.88 
 
 		 449 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  48.73 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  48.06 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  43.45 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  45.31 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  47.83 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  43.3 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  41.8 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  44.97 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  44.02 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  42.42 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  43.02 
 
 		 479 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  41.26 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  40.64 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  41.26 
 
 		 509 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  44.58 
 
 		 590 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  43.13 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  41.58 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  42.98 
 
 		 451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  40.17 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  43.68 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  38.14 
 
 		 462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  34.55 
 
 		 531 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  37.14 
 
 		 551 aa  238  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  36.15 
 
 		 652 aa  167  4e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  33.59 
 
 		 654 aa  163  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  32.75 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.7 
 
 		 650 aa  161  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.69 
 
 		 558 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  31.04 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.77 
 
 		 558 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  32.22 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  31.41 
 
 		 602 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 		 556 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  32.65 
 
 		 549 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.93 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  32.47 
 
 		 550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  31.3 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.59 
 
 		 555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  32.13 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  32.13 
 
 		 542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.19 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  32.6 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.77 
 
 		 647 aa  146  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  31.04 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  31.04 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.86 
 
 		 550 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  31.04 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 581 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.89 
 
 		 550 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  31.7 
 
 		 561 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  29.38 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  31.7 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  29.9 
 
 		 548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.85 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.02 
 
 		 666 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  31.96 
 
 		 545 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  26.82 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  31.27 
 
 		 630 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  30.59 
 
 		 548 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  30.41 
 
 		 557 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  27.14 
 
 		 564 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  30.36 
 
 		 951 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 		 658 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 		 630 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  31.52 
 
 		 649 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  27.45 
 
 		 732 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  26.03 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 633 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  27.54 
 
 		 838 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.94 
 
 		 866 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  27.31 
 
 		 707 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  29.33 
 
 		 706 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 385 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  28.2 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  28.2 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 696 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.71 
 
 		 698 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  27.71 
 
 		 818 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  26.83 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  27.78 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.8 
 
 		 720 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  26.93 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 1597 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  26.47 
 
 		 781 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.6 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  23.48 
 
 		 744 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.11 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>