296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0717 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.73 
 
 		 813 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.73 
 
 		 813 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  46.55 
 
 		 925 aa  724    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  58.28 
 
 		 809 aa  961    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.61 
 
 		 971 aa  701    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 794 aa  1639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  65.44 
 
 		 799 aa  1048    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  49.29 
 
 		 815 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  58.7 
 
 		 788 aa  965    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  59.67 
 
 		 784 aa  981    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  65.09 
 
 		 795 aa  1082    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  48.12 
 
 		 785 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  58.28 
 
 		 809 aa  961    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  63.4 
 
 		 796 aa  1043    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  57.46 
 
 		 786 aa  917    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  59.3 
 
 		 768 aa  936    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  44.71 
 
 		 796 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  41.39 
 
 		 778 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  38.82 
 
 		 998 aa  521  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  35.25 
 
 		 920 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  63.38 
 
 		 154 aa  194  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 		 455 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  66.67 
 
 		 195 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  32.88 
 
 		 479 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  32.42 
 
 		 479 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  33.1 
 
 		 479 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 479 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  31.28 
 
 		 485 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 		 463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  24.84 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  33.67 
 
 		 444 aa  96.3  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  32.49 
 
 		 443 aa  95.5  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.91 
 
 		 654 aa  94.7  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  48.28 
 
 		 279 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.96 
 
 		 451 aa  93.2  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  34.46 
 
 		 647 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 630 aa  91.7  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 560 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 560 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 		 652 aa  87.8  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 815 aa  87.8  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  37.93 
 
 		 499 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  27.95 
 
 		 1053 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  36.31 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  32.2 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  23.55 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.96 
 
 		 974 aa  84.3  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.3 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  23.55 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  24.09 
 
 		 560 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.02 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  27.44 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 398 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  28.33 
 
 		 1033 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  33.73 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  28.17 
 
 		 1033 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 812 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  35.14 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 		 979 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  35.14 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.36 
 
 		 773 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 1077 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.15 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 1058 aa  78.2  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  25.6 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  31.95 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 1035 aa  78.2  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  34.57 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.22 
 
 		 462 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  33.15 
 
 		 488 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  36.49 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  32.75 
 
 		 456 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.8 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  24.59 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  33.92 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  33.13 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  32.67 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  22.99 
 
 		 967 aa  75.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  24.14 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.53 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 		 1029 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.99 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.42 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  24.14 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.99 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.99 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 1028 aa  74.7  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>