38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1534 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  76.92 
 
 		 809 aa  194  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  76.92 
 
 		 809 aa  194  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  77.78 
 
 		 784 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  75.21 
 
 		 788 aa  190  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  77.78 
 
 		 768 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  65.12 
 
 		 786 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  71.79 
 
 		 799 aa  175  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  66.67 
 
 		 794 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  70.09 
 
 		 796 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  64.1 
 
 		 795 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  63.25 
 
 		 785 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  52.14 
 
 		 925 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  56.41 
 
 		 815 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  55.46 
 
 		 813 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  55.46 
 
 		 813 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  51.69 
 
 		 796 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  51.38 
 
 		 778 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  44.44 
 
 		 998 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.3 
 
 		 971 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  44.54 
 
 		 920 aa  91.7  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  42.71 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  36.56 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  35.11 
 
 		 463 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  34.07 
 
 		 649 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  29.91 
 
 		 551 aa  45.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0765  transcription-repair coupling factor  34.75 
 
 		 1128 aa  44.7  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.267338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  37.93 
 
 		 658 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  47.27 
 
 		 451 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  40.82 
 
 		 456 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 485 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 485 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  39.06 
 
 		 560 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  48.08 
 
 		 440 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  47.27 
 
 		 451 aa  42  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0250  transcription-repair coupling factor  30.51 
 
 		 1134 aa  42  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  39.06 
 
 		 560 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  41.18 
 
 		 443 aa  41.2  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>