More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3039 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  56.99 
 
 
658 aa  728    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  83.1 
 
 
666 aa  1089    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
649 aa  1307    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  58.73 
 
 
630 aa  744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  37.31 
 
 
548 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  35.2 
 
 
548 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  34.94 
 
 
557 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  36.8 
 
 
546 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  36.42 
 
 
548 aa  271  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  33.71 
 
 
558 aa  270  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  35.98 
 
 
554 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.67 
 
 
550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  36.2 
 
 
561 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  36.73 
 
 
550 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  35.91 
 
 
549 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.02 
 
 
555 aa  265  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  36.75 
 
 
549 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  36.75 
 
 
549 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  36.75 
 
 
549 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  34.95 
 
 
551 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  34.9 
 
 
558 aa  263  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  36.35 
 
 
549 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  36.91 
 
 
545 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.34 
 
 
558 aa  260  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  36.14 
 
 
549 aa  259  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.06 
 
 
548 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  35.1 
 
 
559 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  35.69 
 
 
545 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  34.72 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  36.03 
 
 
548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  35.54 
 
 
542 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  34.37 
 
 
550 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  35.06 
 
 
555 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  34.54 
 
 
602 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  34.11 
 
 
551 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  34.98 
 
 
556 aa  247  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  34.37 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  33.91 
 
 
548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  35.75 
 
 
590 aa  243  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  30.3 
 
 
564 aa  241  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.13 
 
 
551 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  32.82 
 
 
451 aa  171  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  27.8 
 
 
838 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  36.58 
 
 
647 aa  162  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.5 
 
 
531 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.38 
 
 
720 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 
444 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 
440 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  27.92 
 
 
818 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  28.68 
 
 
866 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  36.51 
 
 
650 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.75 
 
 
652 aa  154  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.05 
 
 
462 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  27.88 
 
 
781 aa  151  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.18 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.55 
 
 
443 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 
654 aa  147  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 
499 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30.95 
 
 
451 aa  141  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  32.99 
 
 
444 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.15 
 
 
468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  28.92 
 
 
590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  29.58 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 
466 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.74 
 
 
456 aa  138  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 
451 aa  137  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  31.26 
 
 
488 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  31.52 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  29.64 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  29.04 
 
 
517 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  31.18 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  30.66 
 
 
531 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 
479 aa  125  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 
509 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  30.85 
 
 
449 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 
509 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 
479 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  31.29 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.47 
 
 
479 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 
463 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 
479 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  27.64 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.66 
 
 
485 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  29.44 
 
 
455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.39 
 
 
485 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  31.47 
 
 
925 aa  93.6  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  28.52 
 
 
768 aa  91.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 
385 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  26.84 
 
 
809 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  26.84 
 
 
809 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 
489 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.61 
 
 
489 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.45 
 
 
998 aa  82.4  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 
784 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 
794 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.57 
 
 
633 aa  78.2  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  31.94 
 
 
778 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 
967 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>