232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2739 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  100 
 
 		 564 aa  1150    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  52.34 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  46.76 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  44.11 
 
 		 551 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  43.24 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  42.7 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  45.82 
 
 		 548 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  43.4 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  43.82 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  42.98 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  44.32 
 
 		 545 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  44.24 
 
 		 554 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  44.04 
 
 		 548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  44.32 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.94 
 
 		 550 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  43.84 
 
 		 561 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  43.32 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.74 
 
 		 558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  43.63 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.14 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  43.6 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  42.47 
 
 		 549 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  42.68 
 
 		 548 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  41.7 
 
 		 581 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  43.24 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  43.19 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  41.52 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  42.7 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  43.6 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  43.6 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  43.6 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  41.97 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.19 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  43.24 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  42.52 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  43.27 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 666 aa  249  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  28.01 
 
 		 781 aa  246  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 630 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  28.36 
 
 		 838 aa  241  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.42 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 649 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  34.22 
 
 		 818 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  31.51 
 
 		 720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  31.56 
 
 		 866 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.95 
 
 		 551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.82 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 444 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  30.98 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.75 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 650 aa  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.95 
 
 		 652 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.54 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 		 590 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.65 
 
 		 654 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  29.04 
 
 		 647 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  28.72 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.18 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.37 
 
 		 468 aa  127  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.43 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 479 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.79 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 531 aa  113  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.6 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.02 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 479 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.55 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  24.44 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.14 
 
 		 485 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  24.86 
 
 		 485 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.64 
 
 		 630 aa  93.2  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  23.27 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.98 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  24.16 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  28.18 
 
 		 920 aa  81.6  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.43 
 
 		 464 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  24.32 
 
 		 998 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  26.83 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  23.9 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  21.2 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 993 aa  63.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  25.45 
 
 		 905 aa  63.5  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  22.54 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  22.94 
 
 		 744 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  30.59 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>