162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3947 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  76.74 
 
 		 548 aa  859    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  79.41 
 
 		 548 aa  873    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  75 
 
 		 549 aa  842    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  75.55 
 
 		 545 aa  813    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  76.1 
 
 		 550 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  76.29 
 
 		 549 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  76.1 
 
 		 551 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1106    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  76.29 
 
 		 549 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  76.47 
 
 		 549 aa  821    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  76.29 
 
 		 549 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  76.47 
 
 		 555 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  72.26 
 
 		 558 aa  820    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  76.29 
 
 		 549 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  79.3 
 
 		 548 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  74.91 
 
 		 581 aa  816    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  74.35 
 
 		 550 aa  815    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  79.12 
 
 		 548 aa  880    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  75.42 
 
 		 542 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  82.17 
 
 		 557 aa  882    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  77.29 
 
 		 556 aa  822    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  76.65 
 
 		 548 aa  845    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  74.82 
 
 		 555 aa  807    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  75.74 
 
 		 545 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  75.55 
 
 		 559 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  77.02 
 
 		 561 aa  841    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  74.68 
 
 		 548 aa  831    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  76.47 
 
 		 554 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  80.81 
 
 		 550 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  78.58 
 
 		 558 aa  879    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  79.6 
 
 		 551 aa  880    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  77.37 
 
 		 548 aa  834    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  77.08 
 
 		 558 aa  869    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  55.35 
 
 		 602 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  47.35 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  43.19 
 
 		 564 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  35.51 
 
 		 666 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  29.95 
 
 		 838 aa  276  9e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  39.07 
 
 		 630 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  29.93 
 
 		 818 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  36.8 
 
 		 649 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  31.95 
 
 		 781 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  38.66 
 
 		 658 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  37.07 
 
 		 866 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  39.63 
 
 		 720 aa  242  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  33.66 
 
 		 451 aa  170  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  33.42 
 
 		 468 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  31.47 
 
 		 652 aa  154  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.2 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.3 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.95 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  31.01 
 
 		 491 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  29.12 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  30.52 
 
 		 654 aa  143  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.34 
 
 		 650 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  32.92 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.1 
 
 		 647 aa  139  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.02 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  30.99 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  30.31 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  30.51 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  30.61 
 
 		 517 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.72 
 
 		 443 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.11 
 
 		 479 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  31.11 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  30.67 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.74 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  28.46 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 479 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 630 aa  98.2  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.96 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  26.84 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.52 
 
 		 479 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  26.96 
 
 		 796 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25.81 
 
 		 998 aa  84  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.16 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.37 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  29.01 
 
 		 951 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 796 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.46 
 
 		 920 aa  79.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 886 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  23.04 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  28.57 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  34.32 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  26.46 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.96 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 		 784 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>