More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0822 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 886 aa  1798    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  56.2 
 
 		 652 aa  295  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  59.85 
 
 		 650 aa  292  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  55.84 
 
 		 654 aa  287  7e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  58.87 
 
 		 647 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  35.71 
 
 		 531 aa  158  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  41.92 
 
 		 630 aa  153  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  33.45 
 
 		 551 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  34.88 
 
 		 444 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  32.61 
 
 		 499 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 		 440 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  32.61 
 
 		 466 aa  118  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.14 
 
 		 494 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  38.69 
 
 		 443 aa  117  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  33.09 
 
 		 466 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 		 509 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 		 509 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  31.54 
 
 		 451 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.82 
 
 		 491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  30.21 
 
 		 462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.8 
 
 		 488 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 551 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  28.62 
 
 		 590 aa  108  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  30.74 
 
 		 554 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 517 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  30.32 
 
 		 468 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.56 
 
 		 551 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.74 
 
 		 556 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.11 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  31.97 
 
 		 548 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  30.49 
 
 		 602 aa  105  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  30.74 
 
 		 555 aa  105  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  30.8 
 
 		 444 aa  105  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.09 
 
 		 449 aa  104  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 479 aa  104  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 		 385 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  29.66 
 
 		 548 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.15 
 
 		 550 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.56 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 581 aa  102  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  32.13 
 
 		 470 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 559 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 550 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.89 
 
 		 558 aa  101  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  31.15 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  30.08 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  35.92 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  30.74 
 
 		 561 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.56 
 
 		 548 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.69 
 
 		 548 aa  98.2  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  30.33 
 
 		 545 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 549 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 549 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 549 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 549 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  29.51 
 
 		 542 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 590 aa  95.9  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 546 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  29.1 
 
 		 549 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 549 aa  95.1  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  29.51 
 
 		 545 aa  95.1  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.28 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  33.72 
 
 		 658 aa  94  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 463 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.69 
 
 		 479 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 		 479 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  26.96 
 
 		 479 aa  92  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  29.1 
 
 		 557 aa  91.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.32 
 
 		 531 aa  91.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.37 
 
 		 464 aa  91.3  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 485 aa  91.3  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  26.52 
 
 		 479 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.71 
 
 		 666 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  26.83 
 
 		 564 aa  90.5  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  37.76 
 
 		 451 aa  90.1  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.36 
 
 		 555 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30.25 
 
 		 451 aa  89  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  40.16 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 479 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  27.21 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 493 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.71 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  27.21 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 1077 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  35.51 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 813 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.59 
 
 		 773 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  27.82 
 
 		 951 aa  78.2  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  28.34 
 
 		 696 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.02 
 
 		 720 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 993 aa  73.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  24.9 
 
 		 1063 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>