More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1769 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 464 aa  944    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  34.59 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  29.88 
 
 		 951 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.4 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  30.79 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  28.79 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  31.29 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 732 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.17 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  28.31 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 706 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  28.81 
 
 		 715 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.93 
 
 		 499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 479 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  30.45 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 		 1597 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  29.58 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  30.53 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 494 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 744 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  28.47 
 
 		 706 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  28.03 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.68 
 
 		 654 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.83 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.7 
 
 		 456 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  28.6 
 
 		 698 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.36 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.86 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.08 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  29.17 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  29.17 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.03 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.99 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  29.07 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.32 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  27.19 
 
 		 707 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30.4 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  26.23 
 
 		 696 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  25.72 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 633 aa  101  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  23.9 
 
 		 843 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25.9 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  25.31 
 
 		 548 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  23.64 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.37 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  24.25 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  23.56 
 
 		 550 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  25.12 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  23.43 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  23.63 
 
 		 1077 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  24.63 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.15 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  23.4 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  22.9 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  22.74 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  24.07 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  23.41 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 967 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  23.1 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  23.62 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  23.74 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  23.4 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 886 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.87 
 
 		 952 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  37.36 
 
 		 630 aa  73.2  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  23.47 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  23.23 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  24.56 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  24.75 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 2759 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.81 
 
 		 974 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2673  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.64 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  24.88 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  23.51 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  23.41 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  23.94 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  23.65 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  21.54 
 
 		 629 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  23.18 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.84 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>