175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2721 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1205    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  51.03 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  48.98 
 
 		 558 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  49.4 
 
 		 581 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  48.55 
 
 		 551 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  49.05 
 
 		 559 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.72 
 
 		 548 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  48.21 
 
 		 549 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  47.72 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  49.31 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  46.76 
 
 		 564 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  48.72 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  47.41 
 
 		 548 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  47.44 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  47.35 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  47.24 
 
 		 545 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.91 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  47.35 
 
 		 561 aa  535  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  47.53 
 
 		 548 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  48.13 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  47.24 
 
 		 551 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  48.72 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  46.95 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  46.72 
 
 		 545 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  47.01 
 
 		 548 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  48.54 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  48.54 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  45.86 
 
 		 550 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  48.54 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  46.23 
 
 		 548 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  47.87 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.83 
 
 		 550 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  48.02 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  48.02 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.66 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  48.44 
 
 		 542 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  31.79 
 
 		 838 aa  290  4e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  41.25 
 
 		 630 aa  276  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  32.85 
 
 		 818 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  30.38 
 
 		 720 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  37.74 
 
 		 658 aa  262  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  37.41 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  31.35 
 
 		 781 aa  253  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  36.36 
 
 		 866 aa  242  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  35.66 
 
 		 649 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 440 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  30.23 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.93 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  29.91 
 
 		 462 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  29.31 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.76 
 
 		 499 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.62 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 		 466 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  29.38 
 
 		 517 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.3 
 
 		 590 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 509 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 509 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  28.89 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  29.62 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 		 451 aa  140  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  27.31 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.21 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 		 488 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 449 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 451 aa  134  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.79 
 
 		 443 aa  130  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  29.27 
 
 		 654 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 652 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 470 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  25.96 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 647 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  26.53 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  25.58 
 
 		 630 aa  99.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  27.35 
 
 		 479 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  26.55 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 485 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 485 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 463 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 886 aa  77  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.5 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.55 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  32.97 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  21.25 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  32.14 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 998 aa  67.8  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.61 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  25.19 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  21.6 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>