203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3950 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  74.32 
 
 		 558 aa  833    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  76.74 
 
 		 548 aa  842    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  75.32 
 
 		 556 aa  829    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  75 
 
 		 550 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  71.53 
 
 		 558 aa  824    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  79.64 
 
 		 545 aa  878    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  73.51 
 
 		 549 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  74.95 
 
 		 548 aa  847    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  80.65 
 
 		 561 aa  903    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  70.75 
 
 		 550 aa  783    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  77.48 
 
 		 550 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  70.02 
 
 		 551 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  76.78 
 
 		 548 aa  857    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  74.91 
 
 		 546 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  73.51 
 
 		 549 aa  816    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  75.23 
 
 		 548 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  75.68 
 
 		 549 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  73.82 
 
 		 551 aa  829    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  73.51 
 
 		 549 aa  816    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  72.36 
 
 		 555 aa  780    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  74.77 
 
 		 549 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 581 aa  1174    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  75.5 
 
 		 555 aa  831    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  77.17 
 
 		 549 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  74.19 
 
 		 558 aa  848    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  74.27 
 
 		 542 aa  812    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  74.42 
 
 		 557 aa  822    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  69.82 
 
 		 548 aa  785    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  77.34 
 
 		 554 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  71.66 
 
 		 548 aa  807    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  77.15 
 
 		 545 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  96.6 
 
 		 559 aa  1076    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  75.91 
 
 		 548 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  54.59 
 
 		 602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  49.4 
 
 		 590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  41.7 
 
 		 564 aa  511  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  29.55 
 
 		 838 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  31.45 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  34.54 
 
 		 666 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  31.45 
 
 		 720 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  37.74 
 
 		 630 aa  267  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  30.63 
 
 		 818 aa  267  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  37.37 
 
 		 866 aa  250  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  34.72 
 
 		 649 aa  246  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  34.44 
 
 		 658 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  33.41 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.23 
 
 		 551 aa  170  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  34.13 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  33.51 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.6 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  34.02 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  32.12 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  28.17 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.76 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  30.51 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.81 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  31.25 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  32.73 
 
 		 456 aa  147  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  32.73 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  30.91 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  30.91 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  31.79 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  28.79 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 652 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 479 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.9 
 
 		 647 aa  137  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.39 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.69 
 
 		 590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 		 654 aa  134  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 		 451 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  32.51 
 
 		 650 aa  132  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  31.79 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30.57 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  30.96 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.8 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.53 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 630 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  36.16 
 
 		 796 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.39 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 886 aa  85.5  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  35.67 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  33.73 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  33.73 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  31.74 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  34.32 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  35.29 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  33.33 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  24.88 
 
 		 998 aa  73.6  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  33.16 
 
 		 925 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  33.87 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  35.67 
 
 		 799 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>