114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05940 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  56.55 
 
 		 818 aa  858    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  100 
 
 		 866 aa  1801    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  60.39 
 
 		 838 aa  909    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  47.62 
 
 		 781 aa  701    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  47.13 
 
 		 720 aa  637    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 590 aa  261  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.87 
 
 		 555 aa  259  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  29.66 
 
 		 554 aa  257  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.02 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  37.87 
 
 		 549 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  38.4 
 
 		 551 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  37.6 
 
 		 557 aa  251  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  34.62 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  37.6 
 
 		 548 aa  247  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  37.15 
 
 		 559 aa  247  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  36.53 
 
 		 548 aa  247  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  37.07 
 
 		 551 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.27 
 
 		 558 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  37.37 
 
 		 581 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  36.32 
 
 		 550 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  36.27 
 
 		 548 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  36.9 
 
 		 555 aa  243  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  36.34 
 
 		 548 aa  242  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.53 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.53 
 
 		 548 aa  240  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  36.07 
 
 		 558 aa  240  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  37.07 
 
 		 546 aa  240  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  36.9 
 
 		 549 aa  238  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  35.37 
 
 		 548 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  36.9 
 
 		 542 aa  237  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  36.9 
 
 		 549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  36 
 
 		 550 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  35.47 
 
 		 561 aa  234  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  36.9 
 
 		 548 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  37.83 
 
 		 602 aa  233  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  36.07 
 
 		 545 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  36.07 
 
 		 545 aa  231  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  31.56 
 
 		 564 aa  208  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 658 aa  157  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 666 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  28.68 
 
 		 649 aa  140  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.43 
 
 		 491 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 551 aa  127  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.48 
 
 		 531 aa  127  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.4 
 
 		 451 aa  125  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  28.04 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 470 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.82 
 
 		 654 aa  110  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.6 
 
 		 468 aa  110  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 		 444 aa  108  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 466 aa  107  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  25.64 
 
 		 488 aa  104  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 517 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  25.24 
 
 		 466 aa  104  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 652 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.65 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  24.46 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.17 
 
 		 590 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.69 
 
 		 440 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 		 449 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.6 
 
 		 479 aa  97.4  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.13 
 
 		 647 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  24.24 
 
 		 509 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 		 499 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  25.61 
 
 		 650 aa  96.3  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.5 
 
 		 443 aa  96.3  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.18 
 
 		 494 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 		 462 aa  92.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  23.01 
 
 		 531 aa  91.3  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.08 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  24.25 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.46 
 
 		 479 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  24.88 
 
 		 456 aa  83.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  22.68 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  22.44 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  24.21 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.72 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  24.12 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  24.2 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.57 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  21.84 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  22.63 
 
 		 385 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  23.54 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2673  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 665 aa  55.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.81 
 
 		 951 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  24.52 
 
 		 925 aa  54.3  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25 
 
 		 920 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  25.43 
 
 		 796 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 886 aa  52  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  22.03 
 
 		 809 aa  51.6  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  22.03 
 
 		 809 aa  51.6  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 901 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 		 581 aa  50.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>