More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2673 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2673  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
665 aa  1340    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  47.4 
 
 
660 aa  600  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.1 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  24.81 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.33 
 
 
951 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.91 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.39 
 
 
464 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.44 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25.19 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  28.37 
 
 
1065 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.87 
 
 
531 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  22.19 
 
 
444 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
427 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  22.89 
 
 
462 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.59 
 
 
427 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.59 
 
 
427 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  30.88 
 
 
636 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.59 
 
 
427 aa  63.9  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.59 
 
 
427 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 
449 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  28.17 
 
 
552 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  23.3 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
432 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0424079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1112  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
593 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.446454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.31 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  31.3 
 
 
579 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 
427 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  32.77 
 
 
427 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.89 
 
 
531 aa  62.4  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.77 
 
 
427 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.09 
 
 
657 aa  62.4  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  36.52 
 
 
972 aa  62.4  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_4468  predicted protein  38.95 
 
 
346 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0346455  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  34.17 
 
 
595 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1775  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  25.19 
 
 
562 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3619  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.19 
 
 
557 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  30.7 
 
 
416 aa  61.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.19 
 
 
559 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.97 
 
 
441 aa  61.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.93 
 
 
427 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3987  DEAD/DEAH box helicase-like  25.19 
 
 
557 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  31.03 
 
 
624 aa  60.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  34.62 
 
 
953 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  27.46 
 
 
567 aa  60.8  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1745  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
432 aa  60.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  34.62 
 
 
953 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.32 
 
 
479 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
502 aa  60.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 
507 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.43 
 
 
559 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 
581 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.65 
 
 
712 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
494 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 
590 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.43 
 
 
559 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_002950  PG2099  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.57 
 
 
427 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  32.69 
 
 
952 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.03 
 
 
632 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.43 
 
 
560 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  29.66 
 
 
607 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  24.4 
 
 
451 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.03 
 
 
634 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  34.58 
 
 
494 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12081  putative ATP-dependent RNA helicase  31.82 
 
 
593 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1532  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  30.77 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 
466 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27370  ATP-dependent RNA helicase  24.59 
 
 
567 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.783828  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  32.71 
 
 
445 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0542  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 
411 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337517  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2315  putative ATP-dependent RNA helicase  24.59 
 
 
553 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.86 
 
 
426 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2144  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.83 
 
 
560 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.616746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  36.45 
 
 
479 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15370  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  27.19 
 
 
558 aa  58.9  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12071  putative ATP-dependent RNA helicase  31.67 
 
 
593 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.73 
 
 
900 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.83 
 
 
669 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  29.05 
 
 
565 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.77 
 
 
507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.05 
 
 
565 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.65 
 
 
894 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.81 
 
 
442 aa  58.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.05 
 
 
565 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  31.58 
 
 
418 aa  58.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 
428 aa  58.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10851  putative ATP-dependent RNA helicase  30.34 
 
 
604 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.638116  normal  0.290308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 
589 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.53 
 
 
614 aa  57.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.87 
 
 
926 aa  57.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.08 
 
 
589 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
442 aa  57.4  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  28.08 
 
 
589 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  34.44 
 
 
949 aa  57.4  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  23.64 
 
 
495 aa  56.6  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  25.83 
 
 
563 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0066  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
414 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  32.22 
 
 
949 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>