More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2162 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  100 
 
 
1065 aa  2151    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  24.53 
 
 
1124 aa  205  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 
1016 aa  205  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1086 aa  186  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.81 
 
 
1143 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.62 
 
 
1080 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.6 
 
 
1052 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.33 
 
 
1086 aa  172  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  22.61 
 
 
1100 aa  168  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.06 
 
 
1051 aa  167  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  22.88 
 
 
853 aa  165  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  26.4 
 
 
1099 aa  164  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  25.51 
 
 
1117 aa  154  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.01 
 
 
1153 aa  151  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.53 
 
 
1109 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.48 
 
 
1127 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  24.84 
 
 
1112 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  24.62 
 
 
1090 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.11 
 
 
1131 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  24.22 
 
 
1087 aa  125  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  23.72 
 
 
1081 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  24.5 
 
 
1065 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  23.87 
 
 
1140 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  22.53 
 
 
1085 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.15 
 
 
1160 aa  115  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  23.74 
 
 
1089 aa  108  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  22.36 
 
 
1153 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  23.32 
 
 
1086 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.21 
 
 
1128 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  23.58 
 
 
1172 aa  95.5  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  23.02 
 
 
919 aa  94.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  23.36 
 
 
952 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.37 
 
 
1125 aa  93.2  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  29.14 
 
 
1083 aa  91.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.37 
 
 
1212 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  23.75 
 
 
1167 aa  90.9  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  22.83 
 
 
1170 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 
963 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  23.87 
 
 
1167 aa  90.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  22.3 
 
 
1172 aa  90.1  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  22.69 
 
 
1167 aa  89.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.39 
 
 
1075 aa  88.2  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.67 
 
 
1075 aa  87.8  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  20.76 
 
 
950 aa  87  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  28.91 
 
 
1074 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  23.36 
 
 
1170 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.93 
 
 
1067 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1109 aa  85.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  31.46 
 
 
1078 aa  84.7  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  27.36 
 
 
1065 aa  84.7  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.43 
 
 
1060 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  24.82 
 
 
829 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  29.52 
 
 
1082 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  22.86 
 
 
958 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  28.93 
 
 
1077 aa  82.4  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.09 
 
 
961 aa  81.3  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  27.42 
 
 
696 aa  81.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  22.95 
 
 
1136 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.54 
 
 
1065 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.54 
 
 
1065 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
1072 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1053 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  30.06 
 
 
1013 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  31.69 
 
 
1077 aa  79.7  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  26.3 
 
 
1078 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 
1075 aa  79  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.03 
 
 
969 aa  79  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  20.71 
 
 
968 aa  78.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.84 
 
 
971 aa  78.2  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  22.55 
 
 
958 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  22.99 
 
 
1137 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  25.07 
 
 
1069 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.85 
 
 
1147 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.55 
 
 
1064 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  21.97 
 
 
1160 aa  76.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  34.29 
 
 
1194 aa  75.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  22.59 
 
 
967 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  33.12 
 
 
1037 aa  75.5  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  25.86 
 
 
1071 aa  75.1  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  22.57 
 
 
1088 aa  75.1  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.58 
 
 
1170 aa  75.1  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.86 
 
 
760 aa  74.7  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30562  predicted protein  25.42 
 
 
474 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.387537 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  21.61 
 
 
988 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  20.92 
 
 
1138 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
937 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.18 
 
 
1170 aa  73.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  21.97 
 
 
1082 aa  73.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  23.69 
 
 
1122 aa  72.4  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
1077 aa  72.4  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  21.5 
 
 
923 aa  72  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.43 
 
 
1169 aa  71.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00583  ATP-dependent RNA helicase dbp10 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU7]  36.26 
 
 
936 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  21.32 
 
 
1116 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 
1046 aa  70.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  35.85 
 
 
1168 aa  70.1  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.72 
 
 
1160 aa  70.1  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.44 
 
 
1069 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
1169 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>