More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2911 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  41.39 
 
 		 1075 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  41.49 
 
 		 1075 aa  789    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  40.78 
 
 		 1082 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  40.76 
 
 		 1074 aa  755    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  41.12 
 
 		 1075 aa  781    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  45.53 
 
 		 1083 aa  954    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.2 
 
 		 1077 aa  748    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  45.15 
 
 		 1089 aa  922    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  40.62 
 
 		 1078 aa  737    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  42.47 
 
 		 1067 aa  854    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.06 
 
 		 1081 aa  916    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  39.03 
 
 		 1069 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  40.09 
 
 		 1071 aa  769    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  41.99 
 
 		 1090 aa  801    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.7 
 
 		 1085 aa  957    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  39.64 
 
 		 1077 aa  760    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  100 
 
 		 1112 aa  2300    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  39.96 
 
 		 1072 aa  755    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  40.67 
 
 		 1087 aa  791    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  39.89 
 
 		 1065 aa  759    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  38.47 
 
 		 1064 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  38.95 
 
 		 1077 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  38.36 
 
 		 1078 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1065 aa  621  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  37.3 
 
 		 1053 aa  611  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  38.58 
 
 		 696 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 		 1131 aa  271  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 1016 aa  259  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.1 
 
 		 1153 aa  244  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1128 aa  237  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.1 
 
 		 1124 aa  232  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27.19 
 
 		 1051 aa  214  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 1086 aa  213  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.15 
 
 		 1143 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.76 
 
 		 1153 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.42 
 
 		 1052 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1109 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1140 aa  202  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 853 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1100 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.11 
 
 		 1086 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.38 
 
 		 1080 aa  178  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.25 
 
 		 1099 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.57 
 
 		 1086 aa  170  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  24.34 
 
 		 1127 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1122 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.86 
 
 		 1060 aa  146  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.84 
 
 		 1065 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.4 
 
 		 1160 aa  138  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.2 
 
 		 1125 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  25.79 
 
 		 942 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1109 aa  104  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.08 
 
 		 932 aa  100  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.07 
 
 		 949 aa  97.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  22.98 
 
 		 975 aa  97.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  24.49 
 
 		 921 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  30.93 
 
 		 1117 aa  97.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  24.15 
 
 		 919 aa  96.3  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  22.84 
 
 		 1043 aa  94.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  24.21 
 
 		 963 aa  93.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.48 
 
 		 966 aa  92.8  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  23.99 
 
 		 915 aa  91.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  23.99 
 
 		 916 aa  91.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  23.01 
 
 		 969 aa  91.7  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  24.57 
 
 		 947 aa  90.9  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.99 
 
 		 933 aa  90.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 1147 aa  90.1  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  23.83 
 
 		 915 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  23.56 
 
 		 967 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.07 
 
 		 966 aa  87.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.74 
 
 		 962 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 813 aa  84.7  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  23.12 
 
 		 1138 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.65 
 
 		 1172 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.06 
 
 		 1194 aa  81.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.26 
 
 		 969 aa  81.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  30.27 
 
 		 915 aa  80.9  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.42 
 
 		 952 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  37.67 
 
 		 1013 aa  79.7  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.68 
 
 		 1065 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.68 
 
 		 1065 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  25.56 
 
 		 1187 aa  79  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.26 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1145 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  28.64 
 
 		 910 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  23.65 
 
 		 988 aa  77.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.29 
 
 		 1172 aa  76.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.03 
 
 		 933 aa  75.5  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  33.77 
 
 		 1169 aa  75.5  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.77 
 
 		 1169 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.47 
 
 		 961 aa  73.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.58 
 
 		 1170 aa  73.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.32 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  32.48 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.1 
 
 		 1082 aa  73.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  31.55 
 
 		 945 aa  73.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  31.82 
 
 		 950 aa  72.8  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  22.97 
 
 		 1062 aa  73.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>