More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0298 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  67.02 
 
 		 1153 aa  1473    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  47.54 
 
 		 1109 aa  1019    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1128 aa  2305    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 1140 aa  1053    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  36.77 
 
 		 1086 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  35.63 
 
 		 1100 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  39.24 
 
 		 853 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1131 aa  279  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 1080 aa  257  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.77 
 
 		 1016 aa  254  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30 
 
 		 1085 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  27.51 
 
 		 1112 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  28.09 
 
 		 1124 aa  235  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.13 
 
 		 1052 aa  233  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.94 
 
 		 1086 aa  229  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.93 
 
 		 1109 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.5 
 
 		 1051 aa  223  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.6 
 
 		 1083 aa  215  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  28.25 
 
 		 1082 aa  214  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  27.04 
 
 		 1074 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 1075 aa  208  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  26.82 
 
 		 1081 aa  205  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  27.39 
 
 		 1065 aa  204  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1075 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.87 
 
 		 1143 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 1072 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  23.75 
 
 		 1075 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  24.78 
 
 		 1127 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 1078 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.31 
 
 		 1089 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  27.61 
 
 		 1071 aa  197  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1086 aa  197  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1077 aa  195  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.84 
 
 		 1064 aa  192  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  26.79 
 
 		 1077 aa  191  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 1077 aa  191  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.84 
 
 		 1160 aa  189  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.24 
 
 		 1125 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  27.33 
 
 		 1067 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.52 
 
 		 1099 aa  186  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  26.79 
 
 		 1090 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  27.69 
 
 		 1069 aa  181  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  25.13 
 
 		 1117 aa  179  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.42 
 
 		 1078 aa  171  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1065 aa  167  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.33 
 
 		 1153 aa  157  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  26.68 
 
 		 1087 aa  121  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 1122 aa  119  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  25.87 
 
 		 1053 aa  104  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  32.63 
 
 		 1037 aa  99.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24.72 
 
 		 1172 aa  99.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  35.43 
 
 		 966 aa  97.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.21 
 
 		 1065 aa  96.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 1046 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  37.89 
 
 		 933 aa  92.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.51 
 
 		 969 aa  92.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.53 
 
 		 1043 aa  92  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  25.68 
 
 		 696 aa  90.9  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 1172 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.34 
 
 		 1065 aa  88.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.34 
 
 		 1065 aa  88.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.66 
 
 		 1147 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  37.79 
 
 		 962 aa  87.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  39.18 
 
 		 941 aa  87.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  39.18 
 
 		 941 aa  87.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.05 
 
 		 972 aa  86.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  34.92 
 
 		 1168 aa  85.1  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  36.71 
 
 		 1013 aa  83.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  24.22 
 
 		 1170 aa  82.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  32.1 
 
 		 813 aa  82  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  23.91 
 
 		 1169 aa  80.9  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.07 
 
 		 1028 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  35.62 
 
 		 933 aa  80.1  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  23.43 
 
 		 1169 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  37.37 
 
 		 1060 aa  79.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  32.37 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.16 
 
 		 1116 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.66 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  37.11 
 
 		 988 aa  78.2  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.52 
 
 		 1038 aa  78.2  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  30.43 
 
 		 952 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  30.43 
 
 		 952 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  30.43 
 
 		 952 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  37.71 
 
 		 964 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 952 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  39.84 
 
 		 1095 aa  75.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  35.4 
 
 		 1129 aa  75.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.85 
 
 		 1069 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1069 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  33.53 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  41.23 
 
 		 1201 aa  75.1  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  28.98 
 
 		 889 aa  74.7  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  41.23 
 
 		 1201 aa  75.1  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 1145 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  31.52 
 
 		 1062 aa  72.8  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  24.8 
 
 		 840 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  37.01 
 
 		 1170 aa  73.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  31.89 
 
 		 1167 aa  72.4  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>