More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1599 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  100 
 
 
889 aa  1816    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  39.63 
 
 
924 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  38.59 
 
 
928 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  37.94 
 
 
910 aa  557  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  36.99 
 
 
915 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  35.91 
 
 
922 aa  545  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  24.29 
 
 
1046 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.1 
 
 
1065 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.1 
 
 
1065 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  31.27 
 
 
1187 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  22.88 
 
 
1086 aa  105  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  24.36 
 
 
960 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  22.61 
 
 
1051 aa  100  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  31.08 
 
 
560 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.1 
 
 
952 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
560 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  31.08 
 
 
560 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  21.89 
 
 
1016 aa  98.2  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  31.47 
 
 
560 aa  97.8  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  34.55 
 
 
555 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  38.82 
 
 
560 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.18 
 
 
1169 aa  94.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.62 
 
 
554 aa  94.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  39.86 
 
 
467 aa  94  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  37.34 
 
 
972 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.61 
 
 
572 aa  93.6  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.72 
 
 
1169 aa  92.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.87 
 
 
1082 aa  90.9  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.94 
 
 
1160 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.25 
 
 
951 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  30.12 
 
 
1170 aa  90.1  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  33.33 
 
 
584 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  33.33 
 
 
1037 aa  88.6  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  32.93 
 
 
1043 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 
1080 aa  88.2  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
1170 aa  87.8  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  28.69 
 
 
760 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  36.59 
 
 
1069 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  23.94 
 
 
1075 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.23 
 
 
1085 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
1069 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.33 
 
 
1052 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.18 
 
 
1212 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  26.91 
 
 
1170 aa  85.9  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.05 
 
 
966 aa  85.5  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  30.16 
 
 
1172 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  33.52 
 
 
1167 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.5 
 
 
969 aa  85.1  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  38.28 
 
 
1168 aa  84.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  33.53 
 
 
922 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.48 
 
 
801 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  31.6 
 
 
829 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.85 
 
 
1194 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  33.33 
 
 
925 aa  83.2  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.11 
 
 
961 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  32.93 
 
 
1100 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  44.83 
 
 
963 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.02 
 
 
919 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.12 
 
 
1172 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  23.57 
 
 
1083 aa  83.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  35.2 
 
 
669 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.65 
 
 
1167 aa  82  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  31.38 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.46 
 
 
933 aa  82  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  32.61 
 
 
1109 aa  82  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
853 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  30 
 
 
967 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  24.07 
 
 
1075 aa  82  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.49 
 
 
927 aa  82  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  30.67 
 
 
949 aa  82.4  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
906 aa  81.6  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  32.37 
 
 
1122 aa  82  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
1145 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  37.86 
 
 
1137 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  32.19 
 
 
774 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.55 
 
 
1013 aa  81.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32 
 
 
1167 aa  81.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.7 
 
 
1147 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.51 
 
 
949 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  36.44 
 
 
541 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 
877 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
968 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  30.14 
 
 
949 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.17 
 
 
961 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.52 
 
 
988 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  41.86 
 
 
966 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.12 
 
 
1138 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  35.92 
 
 
933 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  40.71 
 
 
1136 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  25.36 
 
 
696 aa  79  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  25.46 
 
 
964 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  32.98 
 
 
948 aa  79  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.46 
 
 
963 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  34.36 
 
 
840 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>