More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2251 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  63.91 
 
 
1086 aa  1441    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1100 aa  2261    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  38.43 
 
 
1140 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  94.24 
 
 
853 aa  1663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
1109 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
1128 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  36.39 
 
 
1153 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5514  hypothetical protein  95.15 
 
 
206 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
1016 aa  254  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.72 
 
 
1052 aa  233  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 
1080 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.52 
 
 
1124 aa  227  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
1131 aa  224  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.45 
 
 
1085 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
1086 aa  213  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.97 
 
 
1051 aa  210  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.61 
 
 
1153 aa  205  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25.19 
 
 
1127 aa  202  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  26.13 
 
 
1112 aa  195  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.39 
 
 
1086 aa  189  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
1143 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  25.28 
 
 
1082 aa  178  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.27 
 
 
1125 aa  177  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 
1072 aa  174  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  25.72 
 
 
1075 aa  173  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  26.13 
 
 
1071 aa  171  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.68 
 
 
1075 aa  171  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 
1077 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.61 
 
 
1065 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  26.31 
 
 
1109 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.63 
 
 
1065 aa  165  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  25.7 
 
 
1078 aa  165  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  26.95 
 
 
1090 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1078 aa  165  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  27.29 
 
 
1089 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.6 
 
 
1099 aa  163  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.29 
 
 
1081 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.51 
 
 
1160 aa  162  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
1077 aa  160  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  24.62 
 
 
1053 aa  159  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  25.45 
 
 
1077 aa  159  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.81 
 
 
1074 aa  158  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  27.12 
 
 
1069 aa  157  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  23.73 
 
 
1083 aa  156  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  25.07 
 
 
1075 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.85 
 
 
1064 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  26.07 
 
 
1087 aa  152  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  26.05 
 
 
1067 aa  148  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  25.08 
 
 
1065 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.37 
 
 
1117 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  24.25 
 
 
963 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  22.03 
 
 
1046 aa  95.1  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
947 aa  90.9  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  25.94 
 
 
1060 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  38.78 
 
 
813 aa  90.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
1147 aa  88.2  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.88 
 
 
966 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.33 
 
 
969 aa  87.4  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.22 
 
 
1043 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  31.35 
 
 
1037 aa  86.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 
1122 aa  85.5  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
933 aa  85.1  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.14 
 
 
1028 aa  84  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.25 
 
 
961 aa  83.2  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  32.93 
 
 
889 aa  83.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  39.6 
 
 
1201 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  39.6 
 
 
1201 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.01 
 
 
919 aa  82.8  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.7 
 
 
1160 aa  82.4  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.19 
 
 
1172 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
941 aa  82  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
941 aa  82  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.71 
 
 
1065 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.71 
 
 
1065 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  22.5 
 
 
1138 aa  81.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 
877 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
948 aa  81.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 
962 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  33.33 
 
 
1069 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.39 
 
 
1144 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.69 
 
 
835 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1069 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 
1172 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.7 
 
 
1170 aa  79.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
819 aa  79.3  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.6 
 
 
988 aa  78.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  23.33 
 
 
1129 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.15 
 
 
969 aa  78.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.33 
 
 
971 aa  78.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  32.88 
 
 
952 aa  78.2  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.9 
 
 
1013 aa  78.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  36.02 
 
 
1169 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.41 
 
 
1160 aa  77.4  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  24.49 
 
 
1168 aa  77.4  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  36.02 
 
 
1169 aa  77.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  24.03 
 
 
1167 aa  77.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.68 
 
 
972 aa  77  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 
1167 aa  77  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.27 
 
 
1170 aa  77.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.54 
 
 
933 aa  76.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>