More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5516 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  65.95 
 
 
1086 aa  1154    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  100 
 
 
853 aa  1752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  94.24 
 
 
1100 aa  1663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  39.79 
 
 
1109 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  39.24 
 
 
1128 aa  572  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
1140 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  39.67 
 
 
1153 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.82 
 
 
1052 aa  239  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
1016 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.69 
 
 
1080 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.17 
 
 
1051 aa  223  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.18 
 
 
1124 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 
1131 aa  218  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 
1086 aa  216  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28 
 
 
1153 aa  214  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.71 
 
 
1085 aa  212  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.76 
 
 
1112 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.74 
 
 
1086 aa  185  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25.51 
 
 
1127 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  26.25 
 
 
1075 aa  174  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  24.72 
 
 
1082 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 
1143 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  26.3 
 
 
1071 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1077 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
1075 aa  171  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  27.25 
 
 
1072 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.41 
 
 
1125 aa  168  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.59 
 
 
1065 aa  167  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  26.86 
 
 
1078 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.88 
 
 
1065 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.64 
 
 
1109 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  26.79 
 
 
1069 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 
1077 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.44 
 
 
1090 aa  160  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  24.5 
 
 
1083 aa  160  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  25.14 
 
 
1077 aa  160  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  25.68 
 
 
1078 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.2 
 
 
1081 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.96 
 
 
1074 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.52 
 
 
1067 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  24.77 
 
 
1053 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.35 
 
 
1087 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.16 
 
 
1064 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  26.98 
 
 
1089 aa  151  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.38 
 
 
1160 aa  150  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  24.46 
 
 
1075 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  22.85 
 
 
1099 aa  144  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  25 
 
 
1065 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.71 
 
 
1117 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 
963 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  25.42 
 
 
947 aa  98.2  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  21.9 
 
 
1046 aa  94  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  25 
 
 
1160 aa  90.5  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  25.82 
 
 
1060 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
1122 aa  88.6  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.68 
 
 
1172 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.86 
 
 
1065 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.86 
 
 
1065 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.13 
 
 
1043 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  23.15 
 
 
1144 aa  84.7  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  34.22 
 
 
969 aa  84.7  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  23.34 
 
 
835 aa  84.7  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  35.92 
 
 
933 aa  84.3  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  37.97 
 
 
1201 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
813 aa  83.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
1201 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  24.56 
 
 
1170 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  32.73 
 
 
889 aa  82.4  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.99 
 
 
966 aa  81.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 
1167 aa  81.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
933 aa  80.9  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  23.81 
 
 
1170 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  35.71 
 
 
1037 aa  80.9  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24.34 
 
 
1172 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  23.23 
 
 
1138 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 
1147 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.94 
 
 
941 aa  78.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.77 
 
 
962 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.94 
 
 
941 aa  78.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.41 
 
 
572 aa  77.4  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  35.42 
 
 
942 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.95 
 
 
1028 aa  77.4  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  28.8 
 
 
952 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
877 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  35.53 
 
 
554 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  30.37 
 
 
952 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.68 
 
 
919 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  30.37 
 
 
952 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  24.53 
 
 
1168 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.34 
 
 
1069 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  25.21 
 
 
1160 aa  76.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  23.54 
 
 
1167 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  34.13 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>