More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0490 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  60.08 
 
 
1086 aa  1268    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  75.36 
 
 
1051 aa  1571    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  55.59 
 
 
1086 aa  1176    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  43.22 
 
 
1080 aa  851    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  100 
 
 
1052 aa  2107    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  34.39 
 
 
1127 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  32.69 
 
 
1099 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  35.44 
 
 
1109 aa  462  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  32.64 
 
 
1122 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.95 
 
 
1125 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  32.17 
 
 
1117 aa  328  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  30.51 
 
 
1160 aa  320  7e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.31 
 
 
1124 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
1143 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 
1016 aa  260  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.82 
 
 
853 aa  239  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.79 
 
 
1153 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 
1128 aa  233  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
1100 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
1109 aa  231  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27 
 
 
1131 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 
1140 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.45 
 
 
1085 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  26.42 
 
 
1112 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.4 
 
 
1086 aa  204  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.8 
 
 
1083 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.79 
 
 
1067 aa  190  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  29.34 
 
 
1082 aa  180  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.24 
 
 
1081 aa  179  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.6 
 
 
1065 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  26.54 
 
 
1065 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.69 
 
 
1087 aa  174  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  26.1 
 
 
1077 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  28.43 
 
 
1074 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 
1075 aa  169  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 
1053 aa  162  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
1075 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  24.02 
 
 
1090 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.67 
 
 
1078 aa  160  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  24.9 
 
 
1089 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  26.98 
 
 
1075 aa  159  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  24.28 
 
 
1069 aa  158  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  24.68 
 
 
1072 aa  158  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  25.6 
 
 
1078 aa  157  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  24.48 
 
 
1064 aa  155  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.08 
 
 
1077 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  24.43 
 
 
1071 aa  152  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  23.78 
 
 
1077 aa  149  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.07 
 
 
1065 aa  148  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.59 
 
 
1153 aa  141  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.12 
 
 
1167 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 
1167 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  24.42 
 
 
1167 aa  129  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
1170 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  23.07 
 
 
1065 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  23.07 
 
 
1065 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
942 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.79 
 
 
1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  23.51 
 
 
919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  25 
 
 
949 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  23.77 
 
 
975 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 
1116 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  23.62 
 
 
947 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.82 
 
 
1170 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  24.6 
 
 
1046 aa  109  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  24.87 
 
 
1170 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  22.71 
 
 
1088 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  23.17 
 
 
915 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24.23 
 
 
1172 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.11 
 
 
1082 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  23.01 
 
 
1172 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  23.13 
 
 
915 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  23.13 
 
 
916 aa  105  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.64 
 
 
966 aa  104  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  24.18 
 
 
1169 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.33 
 
 
1013 aa  104  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  23.86 
 
 
1169 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  23.7 
 
 
1170 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  24.49 
 
 
969 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  23.04 
 
 
921 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  23.99 
 
 
1168 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  23.72 
 
 
964 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.71 
 
 
1160 aa  102  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  23.82 
 
 
967 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  23.01 
 
 
963 aa  97.8  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  22.37 
 
 
924 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  24.54 
 
 
1037 aa  97.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  20.36 
 
 
910 aa  95.9  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.3 
 
 
971 aa  96.3  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  24.01 
 
 
669 aa  95.5  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.64 
 
 
1187 aa  95.5  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  24.78 
 
 
835 aa  95.5  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  22.17 
 
 
932 aa  95.1  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  32.38 
 
 
963 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  24.78 
 
 
1144 aa  95.1  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  21.81 
 
 
1212 aa  94.7  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
1147 aa  94  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  23.94 
 
 
960 aa  94.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.63 
 
 
1046 aa  94.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  24.07 
 
 
1137 aa  94.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>