More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1396 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  42.86 
 
 		 1075 aa  852    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  40.4 
 
 		 1075 aa  791    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  50.37 
 
 		 1083 aa  1095    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  100 
 
 		 1065 aa  2168    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  49.12 
 
 		 1089 aa  1013    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.58 
 
 		 1077 aa  731    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  42.57 
 
 		 1074 aa  798    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  40.41 
 
 		 1075 aa  780    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  47.22 
 
 		 1081 aa  994    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  39.89 
 
 		 1112 aa  759    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  53.93 
 
 		 1067 aa  1161    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  41.76 
 
 		 1082 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  74.01 
 
 		 1069 aa  1617    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  67.47 
 
 		 1071 aa  1456    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1065 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  37.75 
 
 		 1053 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  42.52 
 
 		 1090 aa  838    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.3 
 
 		 1085 aa  1024    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  64.74 
 
 		 1077 aa  1439    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  78.42 
 
 		 1072 aa  1717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  73.93 
 
 		 1077 aa  1614    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  40.02 
 
 		 1078 aa  734    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  78.27 
 
 		 1064 aa  1697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  39.39 
 
 		 1087 aa  784    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  73.69 
 
 		 1078 aa  1627    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  39.52 
 
 		 696 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.9 
 
 		 1131 aa  234  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.53 
 
 		 1124 aa  220  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28 
 
 		 1016 aa  218  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 1143 aa  215  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 1128 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.32 
 
 		 1153 aa  196  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 853 aa  171  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 1100 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 1109 aa  167  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.38 
 
 		 1086 aa  160  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1140 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.51 
 
 		 1051 aa  156  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.07 
 
 		 1052 aa  151  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 1080 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.19 
 
 		 1086 aa  147  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.54 
 
 		 1060 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.91 
 
 		 1099 aa  132  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.31 
 
 		 1086 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.12 
 
 		 1125 aa  125  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.39 
 
 		 1127 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  22.76 
 
 		 1160 aa  122  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  23.79 
 
 		 1109 aa  121  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  33.13 
 
 		 1153 aa  111  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 1172 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  34.67 
 
 		 1122 aa  90.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  24.66 
 
 		 941 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.5 
 
 		 1187 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.12 
 
 		 932 aa  86.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  24.38 
 
 		 951 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.36 
 
 		 1065 aa  84.7  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  32.42 
 
 		 1117 aa  84.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  34.66 
 
 		 946 aa  82.4  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.79 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.67 
 
 		 1147 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 813 aa  80.1  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  25.63 
 
 		 966 aa  79.7  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  25.25 
 
 		 969 aa  79.7  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  24.49 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  35.58 
 
 		 1043 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  33.71 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  33.15 
 
 		 933 aa  78.2  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  22.27 
 
 		 915 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  30.95 
 
 		 760 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 948 aa  75.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  35.26 
 
 		 950 aa  75.5  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1037 aa  74.7  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.12 
 
 		 972 aa  73.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.72 
 
 		 1170 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 964 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 		 962 aa  72.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.05 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  35.4 
 
 		 1170 aa  71.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 923 aa  71.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.65 
 
 		 1065 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.65 
 
 		 1065 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.13 
 
 		 969 aa  70.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.94 
 
 		 584 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 1172 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 1116 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.7 
 
 		 1194 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.55 
 
 		 988 aa  69.7  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  35.88 
 
 		 1168 aa  69.7  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1013 aa  69.3  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.03 
 
 		 1169 aa  68.9  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  34.29 
 
 		 1160 aa  68.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.57 
 
 		 949 aa  68.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.64 
 
 		 910 aa  68.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.45 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.72 
 
 		 1046 aa  68.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.11 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  34.52 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.76 
 
 		 971 aa  68.2  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>