More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1748 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  42.67 
 
 		 1075 aa  860    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  45.78 
 
 		 1074 aa  898    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  41.21 
 
 		 1053 aa  757    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  42.11 
 
 		 1077 aa  852    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  44.81 
 
 		 1075 aa  922    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 1067 aa  2191    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  53.93 
 
 		 1065 aa  1145    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  42.47 
 
 		 1112 aa  854    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  55.97 
 
 		 1071 aa  1180    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  45.44 
 
 		 1082 aa  910    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  58.54 
 
 		 1083 aa  1285    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  44.53 
 
 		 1090 aa  927    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  52.05 
 
 		 1064 aa  1110    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.43 
 
 		 1085 aa  1135    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  52.13 
 
 		 1077 aa  1122    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  53.49 
 
 		 1077 aa  1165    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  54.48 
 
 		 1072 aa  1181    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  43.9 
 
 		 1075 aa  874    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  52.32 
 
 		 1081 aa  1136    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  53.67 
 
 		 1069 aa  1132    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  43.72 
 
 		 1078 aa  863    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  43.25 
 
 		 1087 aa  886    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  51.67 
 
 		 1078 aa  1145    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  40.39 
 
 		 1065 aa  740    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  54.51 
 
 		 1089 aa  1197    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  41.64 
 
 		 696 aa  532  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 		 1016 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.03 
 
 		 1124 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  25.79 
 
 		 1131 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.52 
 
 		 1153 aa  228  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27.73 
 
 		 1051 aa  204  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.84 
 
 		 1143 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.79 
 
 		 1052 aa  190  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1128 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 1086 aa  181  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 1080 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 1109 aa  170  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 1140 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25.23 
 
 		 1127 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.08 
 
 		 1099 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.77 
 
 		 1086 aa  161  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.52 
 
 		 853 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.69 
 
 		 1086 aa  151  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.05 
 
 		 1160 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1100 aa  148  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.29 
 
 		 1109 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.74 
 
 		 1117 aa  142  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.5 
 
 		 1060 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.66 
 
 		 1125 aa  132  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.84 
 
 		 961 aa  118  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 967 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.04 
 
 		 966 aa  110  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  25.04 
 
 		 1147 aa  105  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  26 
 
 		 1153 aa  104  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  26.12 
 
 		 949 aa  102  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  23.75 
 
 		 952 aa  100  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  24.04 
 
 		 932 aa  97.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.13 
 
 		 1187 aa  94.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  23.84 
 
 		 933 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  23.38 
 
 		 921 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  23.47 
 
 		 969 aa  87.4  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  32.94 
 
 		 1043 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  36.2 
 
 		 972 aa  85.5  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  25.93 
 
 		 1065 aa  85.5  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1170 aa  85.1  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1122 aa  84.7  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  22.62 
 
 		 915 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  33.53 
 
 		 1169 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.53 
 
 		 1169 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.65 
 
 		 1057 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 941 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 941 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 1116 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  24.88 
 
 		 1082 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  25.88 
 
 		 1145 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  33.55 
 
 		 1044 aa  79.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  34.3 
 
 		 1170 aa  79.7  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  35.9 
 
 		 1172 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  23.49 
 
 		 941 aa  79  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1144 aa  79  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.86 
 
 		 1170 aa  79  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.94 
 
 		 933 aa  78.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.07 
 
 		 835 aa  78.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 813 aa  78.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  25 
 
 		 966 aa  78.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.15 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  32.48 
 
 		 946 aa  77.8  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.4 
 
 		 1095 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1037 aa  77.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.85 
 
 		 1172 aa  77.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 		 964 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  37.7 
 
 		 760 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  36.92 
 
 		 963 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.74 
 
 		 1160 aa  75.5  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  31.58 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.18 
 
 		 1138 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  35.88 
 
 		 1065 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  35.88 
 
 		 1065 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  29.8 
 
 		 910 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>