More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3488 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  49.57 
 
 		 1074 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  53.05 
 
 		 1075 aa  737    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  54.09 
 
 		 1078 aa  716    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  68.2 
 
 		 1090 aa  969    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  49.93 
 
 		 1077 aa  656    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  49.42 
 
 		 1075 aa  671    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  64.49 
 
 		 1087 aa  951    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  54.39 
 
 		 1075 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 696 aa  1447    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  48.2 
 
 		 1082 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  44.76 
 
 		 1089 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.62 
 
 		 1081 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  42.92 
 
 		 1083 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.85 
 
 		 1085 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  41.93 
 
 		 1067 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  39.5 
 
 		 1077 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  40.26 
 
 		 1072 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  39.5 
 
 		 1078 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  39.24 
 
 		 1077 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  39.11 
 
 		 1064 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  39.04 
 
 		 1071 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  38.76 
 
 		 1112 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  37.59 
 
 		 1069 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  39.34 
 
 		 1065 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  36.96 
 
 		 1053 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1065 aa  347  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.19 
 
 		 1131 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 1016 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.95 
 
 		 1160 aa  109  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  22.88 
 
 		 1124 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  24.57 
 
 		 1051 aa  99.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.33 
 
 		 1153 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  23.82 
 
 		 1143 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  25.15 
 
 		 1128 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  23.62 
 
 		 1052 aa  91.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 1080 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.04 
 
 		 1086 aa  87.8  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.67 
 
 		 1099 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 1109 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 1086 aa  86.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.35 
 
 		 1153 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  23.96 
 
 		 1060 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.42 
 
 		 1065 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  32.04 
 
 		 1125 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 		 1100 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.32 
 
 		 1127 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  32.2 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1140 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.47 
 
 		 1086 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.46 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  22.85 
 
 		 1109 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 		 1122 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.57 
 
 		 572 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  21.35 
 
 		 1117 aa  65.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.65 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28.14 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  29.46 
 
 		 966 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  31.13 
 
 		 964 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  30.14 
 
 		 975 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.45 
 
 		 961 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.1 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  28.14 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.06 
 
 		 963 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 641 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  25.79 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1013 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 942 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 1171 aa  57.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  28.02 
 
 		 985 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  28.83 
 
 		 929 aa  57.4  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  30.3 
 
 		 951 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  29.83 
 
 		 948 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  28.38 
 
 		 541 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  25.79 
 
 		 885 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  26.6 
 
 		 1185 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  26.64 
 
 		 967 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 1152 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.15 
 
 		 961 aa  55.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  25.13 
 
 		 872 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  32.24 
 
 		 665 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  26.15 
 
 		 902 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  28.74 
 
 		 1250 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.87 
 
 		 1068 aa  55.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  29.45 
 
 		 960 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  25.29 
 
 		 1086 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>