More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4207 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 1075 aa  807    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  79.93 
 
 		 1069 aa  1754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  74 
 
 		 1064 aa  1602    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  40.53 
 
 		 1082 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.64 
 
 		 1077 aa  735    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  40.42 
 
 		 1074 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  73.93 
 
 		 1065 aa  1633    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  39.22 
 
 		 1112 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  40.07 
 
 		 1075 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1077 aa  2212    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  52.13 
 
 		 1067 aa  1149    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  40.28 
 
 		 1075 aa  834    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  67.47 
 
 		 1071 aa  1469    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  40.04 
 
 		 1053 aa  682    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  42.52 
 
 		 1090 aa  846    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  39.73 
 
 		 1078 aa  731    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.04 
 
 		 1085 aa  1001    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  63.16 
 
 		 1077 aa  1403    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  72.97 
 
 		 1072 aa  1624    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  48.4 
 
 		 1083 aa  1092    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  38.94 
 
 		 1087 aa  791    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  78.25 
 
 		 1078 aa  1746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  47.13 
 
 		 1081 aa  996    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1065 aa  673    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  48.4 
 
 		 1089 aa  1016    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  38.53 
 
 		 696 aa  472  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  28.48 
 
 		 1124 aa  253  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 1131 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 1143 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 1016 aa  225  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.97 
 
 		 1153 aa  208  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1128 aa  194  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  28.17 
 
 		 1086 aa  181  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 853 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 1100 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  23.55 
 
 		 1051 aa  165  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  23.14 
 
 		 1086 aa  158  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.04 
 
 		 1052 aa  158  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1109 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 1080 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 1086 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 1140 aa  134  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.44 
 
 		 1127 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.76 
 
 		 1099 aa  132  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.82 
 
 		 1125 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.29 
 
 		 1060 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  24.59 
 
 		 1122 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.29 
 
 		 1065 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  21.69 
 
 		 1117 aa  117  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  22.45 
 
 		 1109 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  32.89 
 
 		 1153 aa  102  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.63 
 
 		 1160 aa  93.6  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  25.38 
 
 		 916 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  25.38 
 
 		 915 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.46 
 
 		 966 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  25.81 
 
 		 915 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.14 
 
 		 1147 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 		 933 aa  84.7  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  35.33 
 
 		 1037 aa  84.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.52 
 
 		 969 aa  83.2  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.09 
 
 		 962 aa  82  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.33 
 
 		 1065 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.33 
 
 		 1065 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  31.55 
 
 		 1172 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.2 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.3 
 
 		 910 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.67 
 
 		 933 aa  76.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 941 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 941 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  23.22 
 
 		 949 aa  76.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 1013 aa  75.5  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.58 
 
 		 760 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  35.88 
 
 		 1169 aa  75.5  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  36 
 
 		 1169 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.18 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.21 
 
 		 1170 aa  75.1  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  36.92 
 
 		 1043 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.54 
 
 		 1172 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.28 
 
 		 1212 aa  74.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.74 
 
 		 1187 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  32.78 
 
 		 946 aa  73.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  38.17 
 
 		 1168 aa  73.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 948 aa  73.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  32.96 
 
 		 906 aa  73.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 940 aa  73.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  33.83 
 
 		 1170 aa  73.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1144 aa  72.4  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  32.68 
 
 		 1046 aa  72.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.35 
 
 		 835 aa  72  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.24 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  32.42 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  32.34 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.25 
 
 		 969 aa  71.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  36.8 
 
 		 949 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 813 aa  70.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  34.85 
 
 		 1160 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1177 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.87 
 
 		 1194 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  31.87 
 
 		 945 aa  69.3  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>