More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0521 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  48.18 
 
 		 1075 aa  964    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  65.54 
 
 		 1083 aa  1483    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  49.35 
 
 		 1069 aa  1011    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  48.4 
 
 		 1077 aa  1005    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  48 
 
 		 1082 aa  981    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  53.88 
 
 		 1081 aa  1187    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  49.31 
 
 		 1064 aa  1006    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  46.54 
 
 		 1075 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  54.51 
 
 		 1067 aa  1208    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  47.89 
 
 		 1078 aa  1014    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  41.6 
 
 		 1053 aa  770    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  45.15 
 
 		 1112 aa  926    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  49.17 
 
 		 1071 aa  1016    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  49.36 
 
 		 1074 aa  990    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  49.59 
 
 		 1075 aa  1001    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  49.12 
 
 		 1065 aa  1019    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  46.78 
 
 		 1090 aa  986    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1065 aa  732    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  46.29 
 
 		 1078 aa  901    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.49 
 
 		 1085 aa  1180    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  49.45 
 
 		 1077 aa  1062    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  100 
 
 		 1089 aa  2226    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  50.37 
 
 		 1072 aa  1056    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  44.42 
 
 		 1087 aa  931    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  44.01 
 
 		 1077 aa  886    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  44.82 
 
 		 696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 1016 aa  249  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.86 
 
 		 1131 aa  225  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.49 
 
 		 1124 aa  220  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.19 
 
 		 1153 aa  209  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  25.52 
 
 		 1128 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.69 
 
 		 1143 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27.63 
 
 		 1051 aa  183  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  23.68 
 
 		 1153 aa  174  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 1100 aa  168  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 1086 aa  167  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.46 
 
 		 1099 aa  164  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.76 
 
 		 1052 aa  163  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1140 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.11 
 
 		 1109 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  23.37 
 
 		 1080 aa  157  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25 
 
 		 1086 aa  157  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.35 
 
 		 1127 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1122 aa  144  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  22.76 
 
 		 1086 aa  144  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.37 
 
 		 1109 aa  140  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.42 
 
 		 1117 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.43 
 
 		 1125 aa  131  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.74 
 
 		 1065 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1147 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.24 
 
 		 942 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.82 
 
 		 1160 aa  99  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  24.83 
 
 		 941 aa  95.9  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  24.83 
 
 		 941 aa  95.9  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  25.04 
 
 		 966 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.48 
 
 		 962 aa  93.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 933 aa  94  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  24.76 
 
 		 1187 aa  90.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.18 
 
 		 1169 aa  88.2  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 1169 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.58 
 
 		 963 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  24.08 
 
 		 969 aa  83.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  21.53 
 
 		 915 aa  83.2  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  36.18 
 
 		 1037 aa  82.4  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  32.26 
 
 		 946 aa  80.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  22.78 
 
 		 1170 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  21.13 
 
 		 922 aa  79  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.76 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.76 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  30 
 
 		 1170 aa  78.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.98 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.42 
 
 		 1170 aa  78.2  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.95 
 
 		 972 aa  77.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 945 aa  77.4  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  31.33 
 
 		 1043 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 1170 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  22.03 
 
 		 924 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1144 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.39 
 
 		 835 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  32.14 
 
 		 941 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.44 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  22.43 
 
 		 969 aa  75.1  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  32.95 
 
 		 1172 aa  75.1  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 1046 aa  74.7  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.42 
 
 		 1172 aa  74.7  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.33 
 
 		 910 aa  74.7  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  32.34 
 
 		 1137 aa  74.7  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  41.03 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.36 
 
 		 961 aa  74.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 1145 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  24.92 
 
 		 1082 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  31.33 
 
 		 829 aa  73.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  30.27 
 
 		 1131 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 		 948 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  25.18 
 
 		 1116 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.05 
 
 		 1212 aa  72.8  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.08 
 
 		 1160 aa  72.8  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.15 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>